Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHKA1P46020 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHKA1P46020 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms