Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms