Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTNP21246 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTNP21246 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTNP21246 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTNP21246 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTNP21246 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTNP21246 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTNP21246 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTNP21246 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTNP21246 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms