Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms