Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA3P35244 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA3P35244 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA3P35244 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA3P35244 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA3P35244 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA3P35244 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA3P35244 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA3P35244 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPA3P35244 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPA3P35244 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA3P35244 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA3P35244 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA3P35244 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA3P35244 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA3P35244 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms