Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBSP08397 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBSP08397 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBSP08397 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBSP08397 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBSP08397 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBSP08397 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBSP08397 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBSP08397 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBSP08397 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms