Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR2Q2VWA4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR2Q2VWA4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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