Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YHR202WYHR202W 1809 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 PST1YDR055W 1335 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 UBX7YBR273C 1311 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 AAD4YDL243C 990 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 PEF1YGR058W 1008 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 BTN2YGR142W 1233 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 CYC1YJR048W 330 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YUH1YJR099W 711 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 RNA1YMR235C 1224 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YBR016WYBR016W 387 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 DCI1YOR180C 816 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 ARL3YPL051W 597 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 PDR10YOR328W 4695 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 RSC6YCR052W 1452 nt5.58□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YDR417CYDR417C 372 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YHL044WYHL044W 708 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YLR125WYLR125W 411 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 DCS1YLR270W 1053 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 QCR2YPR191W 1107 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YMR102CYMR102C 2505 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 SPS2YDR522C 1509 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 STB2YMR053C 2553 nt5.57□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 HAP4YKL109W 1665 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 BUD7YOR299W 2241 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 PRP18YGR006W 756 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 MIC26YGR235C 702 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 APS1YLR170C 471 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YLR296WYLR296W 327 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 NHP6AYPR052C 282 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 GCN20YFR009W 2259 nt5.56□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 NUF2YOL069W 1356 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 MEF1YLR069C 2286 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 COM2YER130C 1332 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YJL032WYJL032W 315 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 MRPL39YML009C 213 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 SYC1YOR179C 567 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 HUA2YOR284W 732 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 ATP20YPR020W 348 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 ECM33YBR078W 1290 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 PBP2YBR233W 1242 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 SED4YCR067C 3198 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 GZF3YJL110C 1656 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 IKS1YJL057C 2004 nt5.55□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 NOP58YOR310C 1536 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 SUP45YBR143C 1314 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YLR108CYLR108C 1458 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 BOI2YER114C 3123 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YDL124WYDL124W 939 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 STE2YFL026W 1296 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 RPL28YGL103W 450 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 PFS1YHR185C 714 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 TDA5YLR426W 981 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 TRI1YMR233W 681 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 MGR2YPL098C 342 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 DIM1YPL266W 957 nt5.54□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YDL027CYDL027C 1263 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 SNU23YDL098C 585 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 RPL22BYFL034C-A 369 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YGL117WYGL117W 798 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 DAM1YGR113W 1032 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 EOS1YNL080C 1101 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 MAP2YBL091C 1266 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 TAF14YPL129W 735 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 SAC1YKL212W 1872 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 DNF2YDR093W 4839 nt5.53□□□□□ -1.52
SSF2Q12153 MCM2YBL023C 2607 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 SRB7YDR308C 423 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 SCS2YER120W 735 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 TEF4YKL081W 1239 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 YLL037WYLL037W 381 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 END3YNL084C 1050 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 snR10snR10 245 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 EXO1YOR033C 2109 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 MED8YBR193C 672 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 SAG1YJR004C 1953 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 RRP3YHR065C 1506 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 CLG1YGL215W 1359 nt5.52□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 UBA1YKL210W 3075 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 NNK1YKL171W 2787 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 GAS4YOL132W 1416 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 YCR007CYCR007C 720 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 GPM2YDL021W 936 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 YEL010WYEL010W 351 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 ARC1YGL105W 1131 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 NAT2YGR147C 867 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 YHR173CYHR173C 339 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 OXR1YPL196W 822 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 GRS1YBR121C 2004 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 PRO2YOR323C 1371 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 STP4YDL048C 1473 nt5.51□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 YDR042CYDR042C 603 nt5.5□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 SUR2YDR297W 1050 nt5.5□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 RPN9YDR427W 1182 nt5.5□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 TOS8YGL096W 831 nt5.5□□□□□ -1.53
SSF2Q12153 OPY2YPR075C 1083 nt5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 220.6 ms