Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD10P28358 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms