Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDP1Q9P0J1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDP1Q9P0J1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms