Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPNS2Q96L46 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms