Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A4Q6P5W5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms