Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms