Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms