Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
U3KQE9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
U3KQE9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
U3KQE9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
U3KQE9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
U3KQE9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
U3KQE9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
U3KQE9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms