Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD3Q9UJU5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms