Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHACTR1Q9C0D0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms