Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms