Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAD1Q15797 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
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