Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YGR283CYGR283C 1026 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 MTD1YKR080W 963 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 NSE1YLR007W 1011 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YLR042CYLR042C 486 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 UPS2YLR168C 693 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 TMA16YOR252W 537 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YPR142CYPR142C 564 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 HXT5YHR096C 1779 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 NGL2YMR285C 1548 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 PRM7YDL039C 2097 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 SRO9YCL037C 1305 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 snR7-SsnR7-S 179 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 RHO3YIL118W 696 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 RSM26YJR101W 801 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 CNS1YBR155W 1158 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 NPL4YBR170C 1743 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 MDL1YLR188W 2088 nt4.82□□□□□ -1.64
VFA1P40080 HOT13YKL084W 351 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YKL177WYKL177W 339 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YLR365WYLR365W 333 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YMR082CYMR082C 357 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 ERD2YBL040C 660 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 CUS2YNL286W 858 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 MDJ2YNL328C 441 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 CPR8YNR028W 927 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 VPS21YOR089C 633 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 CSH1YBR161W 1131 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YBR139WYBR139W 1527 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 KCH1YJR054W 1494 nt4.81□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 RRP8YDR083W 1179 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 CYM1YDR430C 2970 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 ACT1YFL039C 1128 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 GEP7YGL057C 864 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 FRA2YGL220W 363 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YAL064WYAL064W 285 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 JLP1YLL057C 1239 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 ELO3YLR372W 1038 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 POP8YBL018C 402 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YNL217WYNL217W 981 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YOL118CYOL118C 309 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 SET6YPL165C 1122 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 MUM2YBR057C 1101 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YGR125WYGR125W 3111 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 PEP5YMR231W 3090 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 TRM1YDR120C 1713 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 WTM2YOR229W 1404 nt4.8□□□□□ -1.64
VFA1P40080 ACS2YLR153C 2052 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 MKS1YNL076W 1755 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YCR015CYCR015C 954 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 ALB1YJL122W 528 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 AAD10YJR155W 867 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 ECM15YBL001C 315 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YLR366WYLR366W 306 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 PNT1YOR266W 1272 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 GRE1YPL223C 507 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 REI1YBR267W 1182 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 HSP82YPL240C 2130 nt4.79□□□□□ -1.64
VFA1P40080 OLE1YGL055W 1533 nt4.78□□□□□ -1.64
VFA1P40080 NOP58YOR310C 1536 nt4.78□□□□□ -1.64
VFA1P40080 VPS1YKR001C 2115 nt4.78□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt4.78□□□□□ -1.64
VFA1P40080 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.78□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YML094C-AYML094C-A 402 nt4.78□□□□□ -1.64
VFA1P40080 CDC21YOR074C 915 nt4.78□□□□□ -1.64
VFA1P40080 ARN2YHL047C 1863 nt4.77□□□□□ -1.65
VFA1P40080 STD1YOR047C 1335 nt4.77□□□□□ -1.65
VFA1P40080 HIS6YIL020C 786 nt4.77□□□□□ -1.65
VFA1P40080 UBI4YLL039C 1146 nt4.77□□□□□ -1.65
VFA1P40080 ORM2YLR350W 651 nt4.77□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.77□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YBL096CYBL096C 309 nt4.77□□□□□ -1.65
VFA1P40080 SPR28YDR218C 1272 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 BUD16YEL029C 939 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 HAT2YEL056W 1206 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YIL163CYIL163C 354 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YIL165CYIL165C 360 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 SHE1YBL031W 1017 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YNL171CYNL171C 369 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 SUA7YPR086W 1038 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 ECM8YBR076W 1065 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 POP4YBR257W 840 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 STB3YDR169C 1542 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 NGL3YML118W 1518 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 MMT1YMR177W 1533 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YMR221CYMR221C 1515 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 LAP3YNL239W 1365 nt4.76□□□□□ -1.65
VFA1P40080 DBP5YOR046C 1449 nt4.75□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YDR056CYDR056C 618 nt4.75□□□□□ -1.65
VFA1P40080 CTH1YDR151C 978 nt4.75□□□□□ -1.65
VFA1P40080 SPT3YDR392W 1014 nt4.75□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4.75□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt4.75□□□□□ -1.65
VFA1P40080 IZH4YOL101C 939 nt4.75□□□□□ -1.65
VFA1P40080 YBR016WYBR016W 387 nt4.75□□□□□ -1.65
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