Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF12Q8WXF0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SRSF12Q8WXF0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms