Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms