Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD1Q02809 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLOD1Q02809 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms