Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 DCS2YOR173W 1062 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 FBP26YJL155C 1359 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 ATM1YMR301C 2073 nt4.49□□□□□ -1.69
SEC28P40509 SVF1YDR346C 1446 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 IMA3YIL172C 1770 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 IMA4YJL221C 1770 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 SYF1YDR416W 2580 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 LSO1YJR005C-A 282 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 JLP1YLL057C 1239 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 MGR2YPL098C 342 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 INA17YPL099C 549 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YPR174CYPR174C 666 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 PHO87YCR037C 2772 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YER077CYER077C 2067 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 ADP1YCR011C 3150 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YPL260WYPL260W 1656 nt4.48□□□□□ -1.69
SEC28P40509 PCL9YDL179W 915 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 DOS2YDR068W 933 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YDR249CYDR249C 1122 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 MRP13YGR084C 1020 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 VTA1YLR181C 993 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YLR326WYLR326W 723 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YMR085WYMR085W 1299 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 CUZ1YNL155W 825 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 YBL077WYBL077W 432 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 CIN5YOR028C 888 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 CBP3YPL215W 1008 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 PEP5YMR231W 3090 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 MPC54YOR177C 1395 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 ZPR1YGR211W 1461 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 CYM1YDR430C 2970 nt4.47□□□□□ -1.69
SEC28P40509 LYS2YBR115C 4179 nt4.46□□□□□ -1.69
SEC28P40509 PTR3YFR029W 2037 nt4.46□□□□□ -1.69
SEC28P40509 PER1YCR044C 1074 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC28P40509 TVP38YKR088C 1014 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC28P40509 TDA5YLR426W 981 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YLR462WYLR462W 609 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YIM2YMR151W 438 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC28P40509 ARC40YBR234C 1155 nt4.46□□□□□ -1.7
SEC28P40509 ALE1YOR175C 1860 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 PHO84YML123C 1764 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 GAD1YMR250W 1758 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 RCM1YNL022C 1473 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 NAM9YNL137C 1461 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 ECM34YHL043W 513 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 OAR1YKL055C 837 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 NMA1YLR328W 1206 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 POP3YNL282W 588 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YBR016WYBR016W 387 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 GRC3YLL035W 1899 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 THS1YIL078W 2205 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 ALR2YFL050C 2577 nt4.45□□□□□ -1.7
SEC28P40509 VID22YLR373C 2706 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 NMD3YHR170W 1557 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 IME4YGL192W 1803 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 NUP42YDR192C 1293 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YGL199CYGL199C 471 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 ECM15YBL001C 315 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 IBD2YNL164C 1056 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 STB3YDR169C 1542 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 NOP58YOR310C 1536 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 MET4YNL103W 2019 nt4.44□□□□□ -1.7
SEC28P40509 BCP1YDR361C 852 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 LSM6YDR378C 261 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 MMM1YLL006W 1281 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 UBI4YLL039C 1146 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 BUD8YLR353W 1812 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YML020WYML020W 1995 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 MNN4YKL201C 3537 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 SWP82YFL049W 1872 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 LAS21YJL062W 2493 nt4.43□□□□□ -1.7
SEC28P40509 PAH1YMR165C 2589 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 SLX8YER116C 825 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 ERG26YGL001C 1050 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YHB1YGR234W 1200 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YIL165CYIL165C 360 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YKL071WYKL071W 771 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 EMG1YLR186W 759 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 MPD1YOR288C 957 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 NAM2YLR382C 2685 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 UBP10YNL186W 2379 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 ISR1YPR106W 1332 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 PRR2YDL214C 2100 nt4.42□□□□□ -1.7
SEC28P40509 UBP6YFR010W 1500 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 PUS9YDL036C 1389 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 IMD2YHR216W 1572 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 RPB7YDR404C 516 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YLF2YHL014C 1218 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 FBP1YLR377C 1047 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 AIM41YOR215C 558 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 TEL1YBL088C 8364 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 YRB30YGL164C 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 SPO1YNL012W 1896 nt4.41□□□□□ -1.7
SEC28P40509 SAS4YDR181C 1446 nt4.4□□□□□ -1.7
SEC28P40509 SPR6YER115C 576 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.4□□□□□ -1.71
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