Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 RNH202YDR279W 1053 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YBL094CYBL094C 333 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 AIF1YNR074C 1137 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YOL162WYOL162W 648 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 BTS1YPL069C 1008 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 UMP1YBR173C 447 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 ARC40YBR234C 1155 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 OCT1YKL134C 2319 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 PAH1YMR165C 2589 nt4.91□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YTA6YPL074W 2265 nt4.9□□□□□ -1.62
VFA1P40080 TRM13YOL125W 1431 nt4.9□□□□□ -1.62
VFA1P40080 NTH2YBR001C 2343 nt4.9□□□□□ -1.62
VFA1P40080 VBA1YMR088C 1689 nt4.9□□□□□ -1.62
VFA1P40080 NOC4YPR144C 1659 nt4.9□□□□□ -1.62
VFA1P40080 YDL012CYDL012C 324 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 PAD1YDR538W 729 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 COA3YJL062W-A 258 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YJR012CYJR012C 624 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SIC1YLR079W 855 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 FBP1YLR377C 1047 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 RPS10BYMR230W 318 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 ARG4YHR018C 1392 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 EGT2YNL327W 3126 nt4.9□□□□□ -1.63
VFA1P40080 ADE6YGR061C 4077 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 KAP114YGL241W 3015 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CAB3YKL088W 1716 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CPR4YCR069W 957 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 TVP38YKR088C 1014 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 URA4YLR420W 1095 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 RUF20RUF20 443 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YNL019CYNL019C 855 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YNL033WYNL033W 855 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 AIM39YOL053W 1188 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 ENV9YOR246C 993 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 MCM4YPR019W 2802 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 EAR1YMR171C 1653 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CYK3YDL117W 2658 nt4.89□□□□□ -1.63
VFA1P40080 IMA3YIL172C 1770 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 IMA4YJL221C 1770 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 TEC1YBR083W 1461 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 NUP2YLR335W 2163 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YLR345WYLR345W 1530 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 NMD3YHR170W 1557 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 PIB1YDR313C 861 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 TYW3YGL050W 822 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YNL226WYNL226W 411 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 TGS1YPL157W 948 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SWC3YAL011W 1878 nt4.88□□□□□ -1.63
VFA1P40080 MAG2YLR427W 2013 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SIF2YBR103W 1608 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 GIC2YDR309C 1152 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YFR035CYFR035C 345 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 JAC1YGL018C 555 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YGR122WYGR122W 1209 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YIF1YNL263C 945 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CMR3YPR013C 954 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 ECM33YBR078W 1290 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SHE3YBR130C 1278 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 STR2YJR130C 1920 nt4.87□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YDL186WYDL186W 834 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 TRM8YDL201W 861 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SEC28YIL076W 891 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 MNN11YJL183W 1269 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 LSO1YJR005C-A 282 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 RUF21RUF21 707 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 PDR16YNL231C 1056 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YNR061CYNR061C 660 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 MGR2YPL098C 342 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SUT2YPR009W 807 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 snR32snR32 188 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 TSL1YML100W 3297 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CTT1YGR088W 1689 nt4.86□□□□□ -1.63
VFA1P40080 MET4YNL103W 2019 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 ATM1YMR301C 2073 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 PEX19YDL065C 1029 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 ENT5YDR153C 1236 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 ATG33YLR356W 594 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CSR1YLR380W 1227 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CPR3YML078W 549 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SLX1YBR228W 915 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CPS1YJL172W 1731 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 GAD1YMR250W 1758 nt4.85□□□□□ -1.63
VFA1P40080 IMD2YHR216W 1572 nt4.84□□□□□ -1.63
VFA1P40080 PER1YCR044C 1074 nt4.84□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YGR149WYGR149W 1299 nt4.84□□□□□ -1.63
VFA1P40080 PEX21YGR239C 867 nt4.84□□□□□ -1.63
VFA1P40080 CIN5YOR028C 888 nt4.84□□□□□ -1.63
VFA1P40080 YOR342CYOR342C 960 nt4.84□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SPO19YPL130W 672 nt4.84□□□□□ -1.63
VFA1P40080 SLM4YBR077C 489 nt4.84□□□□□ -1.63
VFA1P40080 PRM1YNL279W 1986 nt4.84□□□□□ -1.64
VFA1P40080 MDM38YOL027C 1722 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 YDL158CYDL158C 309 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 RRP17YDR412W 708 nt4.83□□□□□ -1.64
VFA1P40080 RNA15YGL044C 891 nt4.83□□□□□ -1.64
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