Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA3P35244 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA3P35244 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA3P35244 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPA3P35244 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA3P35244 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA3P35244 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA3P35244 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA3P35244 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA3P35244 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA3P35244 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA3P35244 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA3P35244 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA3P35244 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA3P35244 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA3P35244 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA3P35244 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA3P35244 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA3P35244 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA3P35244 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA3P35244 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA3P35244 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA3P35244 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms