Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF888P0CJ79 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF888P0CJ79 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms