Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MUSKO15146 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MUSKO15146 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MUSKO15146 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MUSKO15146 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MUSKO15146 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MUSKO15146 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUSKO15146 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MUSKO15146 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUSKO15146 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUSKO15146 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MUSKO15146 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUSKO15146 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUSKO15146 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUSKO15146 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUSKO15146 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUSKO15146 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUSKO15146 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MUSKO15146 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MUSKO15146 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MUSKO15146 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
MUSKO15146 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUSKO15146 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUSKO15146 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUSKO15146 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUSKO15146 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MUSKO15146 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms