Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3AQ9NVI7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms