Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNPPD1Q9BV87 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms