Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms