Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD1Q96JS3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms