Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP33Q8TEY7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms