Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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