Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 SNF3YDL194W 2655 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 TSL1YML100W 3297 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 TDA6YPR157W 1404 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 AIR2YDL175C 1035 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 DBP8YHR169W 1296 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 POP8YBL018C 402 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YMR245WYMR245W 621 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 NRM1YNR009W 750 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 CNS1YBR155W 1158 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 SLX1YBR228W 915 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 SWI3YJL176C 2478 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YMR102CYMR102C 2505 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 PHO90YJL198W 2646 nt5.93□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 GRS1YBR121C 2004 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 SSY5YJL156C 2100 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 SAF1YBR280C 1914 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 PIB1YDR313C 861 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 MTD1YKR080W 963 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 SIC1YLR079W 855 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 UPS2YLR168C 693 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 MKK2YPL140C 1521 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YMR111CYMR111C 1389 nt5.92□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 OXP1YKL215C 3861 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YDL158CYDL158C 309 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 RRP8YDR083W 1179 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YGR149WYGR149W 1299 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 ORM2YLR350W 651 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 CPR3YML078W 549 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 CCS1YMR038C 750 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 SLM4YBR077C 489 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 BUD22YMR014W 1560 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 ESF1YDR365C 1887 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 HES1YOR237W 1305 nt5.91□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 SLC1YDL052C 912 nt5.9□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 TRM8YDL201W 861 nt5.9□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YGR283CYGR283C 1026 nt5.9□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YKL177WYKL177W 339 nt5.9□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YML094C-AYML094C-A 402 nt5.9□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YOL118CYOL118C 309 nt5.9□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 TMA16YOR252W 537 nt5.9□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 YPR142CYPR142C 564 nt5.9□□□□□ -1.46
NSE3Q05541 PRM7YDL039C 2097 nt5.9□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 EMP46YLR080W 1335 nt5.9□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 TRM1YDR120C 1713 nt5.9□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 ROT2YBR229C 2865 nt5.9□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 SLT2YHR030C 1455 nt5.9□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 RRP3YHR065C 1506 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 DNF2YDR093W 4839 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 ACT1YFL039C 1128 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 CUS2YNL286W 858 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 AIF1YNR074C 1137 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 PNT1YOR266W 1272 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 SHE3YBR130C 1278 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 CSH1YBR161W 1131 nt5.89□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 SIF2YBR103W 1608 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 BIT2YBR270C 1638 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 KRS1YDR037W 1776 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 MBP1YDL056W 2502 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 GEP7YGL057C 864 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 MRF1YGL143C 1242 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YLR346CYLR346C 306 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YLR365WYLR365W 333 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YLR366WYLR366W 306 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 ERD2YBL040C 660 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 MDJ2YNL328C 441 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 CPR8YNR028W 927 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 STB3YDR169C 1542 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 ASF2YDL197C 1578 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 MNN2YBR015C 1794 nt5.88□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YDL012CYDL012C 324 nt5.87□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.87□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 RHO4YKR055W 876 nt5.87□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YNL217WYNL217W 981 nt5.87□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 SET6YPL165C 1122 nt5.87□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 MKS1YNL076W 1755 nt5.87□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 TUP1YCR084C 2142 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 RFT1YBL020W 1725 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 HAT2YEL056W 1206 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YGL218WYGL218W 651 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 FRA2YGL220W 363 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 HIS6YIL020C 786 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YAL064WYAL064W 285 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 RUF21RUF21 707 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 IZH4YOL101C 939 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 MUM2YBR057C 1101 nt5.86□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 MGS1YNL218W 1764 nt5.85□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 HIR2YOR038C 2628 nt5.85□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 ATH1YPR026W 3636 nt5.85□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 LAP3YNL239W 1365 nt5.85□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 RPT2YDL007W 1314 nt5.85□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YCR015CYCR015C 954 nt5.85□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 YDR417CYDR417C 372 nt5.85□□□□□ -1.47
NSE3Q05541 BUD14YAR014C 2130 nt5.85□□□□□ -1.47
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