Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSE1LP55060 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSE1LP55060 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms