Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC78A2IDD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms