Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSPB3Q12988 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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