Protein–RNA interactions for Protein: Q06164

MMS22, E3 ubiquitin-protein ligase substrate receptor MMS22, yeastyeast

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMS22Q06164 VPS73YGL104C 1461 nt5.96□□□□□ -1.45
MMS22Q06164 VPS53YJL029C 2469 nt5.96□□□□□ -1.45
MMS22Q06164 ROD1YOR018W 2514 nt5.96□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 GLO4YOR040W 858 nt5.96□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 NGL2YMR285C 1548 nt5.95□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 RPL34AYER056C-A 366 nt5.95□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 YNR061CYNR061C 660 nt5.95□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 PWR1PWR1 941 nt5.95□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 PAP1YKR002W 1707 nt5.94□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 EIS1YMR031C 2532 nt5.94□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 ISA1YLL027W 753 nt5.94□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 FHL1YPR104C 2811 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 BRE4YDL231C 3378 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 VAS1YGR094W 3315 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 KIC1YHR102W 3243 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 MDR1YGR100W 2853 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 MRPL7YDR237W 879 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 RPL19BYBL027W 570 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 BMT2YBR141C 1014 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 SRP72YPL210C 1923 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 DNF2YDR093W 4839 nt5.93□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 JLP1YLL057C 1239 nt5.92□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 YBL059WYBL059W 582 nt5.92□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.92□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 LDB19YOR322C 2457 nt5.92□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 AIM3YBR108W 2844 nt5.91□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 TOG1YER184C 2385 nt5.91□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 HST1YOL068C 1512 nt5.91□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 FAT1YBR041W 2010 nt5.91□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 YGR125WYGR125W 3111 nt5.91□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 ACE2YLR131C 2313 nt5.91□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 MTC4YBR255W 2085 nt5.91□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 BIK1YCL029C 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 TEL2YGR099W 2067 nt5.9□□□□□ -1.46
MMS22Q06164 ADE6YGR061C 4077 nt5.9□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 UPC2YDR213W 2742 nt5.9□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 URA3YEL021W 804 nt5.9□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 MAG1YER142C 891 nt5.9□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 FOL2YGR267C 732 nt5.9□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 YJL218WYJL218W 591 nt5.9□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 YLR049CYLR049C 1287 nt5.9□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 VBA2YBR293W 1425 nt5.89□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 GAS3YMR215W 1575 nt5.89□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 COX19YLL018C-A 297 nt5.89□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 NRM1YNR009W 750 nt5.89□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 ADP1YCR011C 3150 nt5.88□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 PTA1YAL043C 2358 nt5.88□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 APA2YDR530C 978 nt5.88□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 YMR114CYMR114C 1107 nt5.88□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 PBS2YJL128C 2007 nt5.87□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 RMD1YDL001W 1293 nt5.87□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 SRB6YBR253W 366 nt5.87□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 CYK3YDL117W 2658 nt5.87□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 BNA1YJR025C 534 nt5.86□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 URA4YLR420W 1095 nt5.86□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 YBL036CYBL036C 774 nt5.86□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 SUB2YDL084W 1341 nt5.86□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 YDR271CYDR271C 372 nt5.85□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 YSF3YNL138W-A 258 nt5.85□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 CDC21YOR074C 915 nt5.85□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 RPO31YOR116C 4383 nt5.85□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 THI7YLR237W 1797 nt5.85□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 PCL10YGL134W 1302 nt5.85□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 GUP2YPL189W 1830 nt5.85□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 YGR017WYGR017W 894 nt5.84□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 MRT4YKL009W 711 nt5.84□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 CWC27YPL064C 906 nt5.84□□□□□ -1.47
MMS22Q06164 SEA4YBL104C 3117 nt5.84□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 YEL074WYEL074W 339 nt5.83□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 GAL4YPL248C 2646 nt5.83□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 TCB3YML072C 4638 nt5.83□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 YGR139WYGR139W 339 nt5.83□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.83□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 MTC3YGL226W 372 nt5.82□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 YKR104WYKR104W 921 nt5.82□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 SHE1YBL031W 1017 nt5.82□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 HRK1YOR267C 2280 nt5.81□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 NOG1YPL093W 1944 nt5.81□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 COQ5YML110C 924 nt5.81□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 YGR018CYGR018C 330 nt5.8□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.8□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 OAR1YKL055C 837 nt5.8□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 CHK1YBR274W 1584 nt5.79□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 GPI12YMR281W 915 nt5.79□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 STP22YCL008C 1158 nt5.79□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 MIS1YBR084W 2928 nt5.79□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 IDS2YJL146W 1410 nt5.79□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 YTA7YGR270W 4140 nt5.78□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 ELF1YKL160W 438 nt5.78□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 OSW1YOR255W 837 nt5.78□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 FSH3YOR280C 801 nt5.78□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 FLC3YGL139W 2409 nt5.78□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 SKG6YHR149C 2205 nt5.78□□□□□ -1.48
MMS22Q06164 MKK1YOR231W 1527 nt5.77□□□□□ -1.49
MMS22Q06164 RIB4YOL143C 510 nt5.77□□□□□ -1.49
MMS22Q06164 SWH1YAR042W 3567 nt5.77□□□□□ -1.49
MMS22Q06164 LCB2YDR062W 1686 nt5.77□□□□□ -1.49
MMS22Q06164 YDR250CYDR250C 276 nt5.77□□□□□ -1.49
MMS22Q06164 snR32snR32 188 nt5.77□□□□□ -1.49
MMS22Q06164 YEN1YER041W 2280 nt5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.6 ms