Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA4P43358 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms