Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 VPS75YNL246W 795 nt17.15■□□□□ 0.34
TY2B-BQ12491 AQY1YPR192W 918 nt17.15■□□□□ 0.34
TY2B-BQ12491 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt17.15■□□□□ 0.34
TY2B-BQ12491 ATF2YGR177C 1608 nt17.14■□□□□ 0.34
TY2B-BQ12491 SWC5YBR231C 912 nt17.14■□□□□ 0.33
TY2B-BQ12491 RBG2YGR173W 1107 nt17.11■□□□□ 0.33
TY2B-BQ12491 RRT12YCR045C 1476 nt17.11■□□□□ 0.33
TY2B-BQ12491 CCT4YDL143W 1587 nt17.1■□□□□ 0.33
TY2B-BQ12491 YBR220CYBR220C 1683 nt17.06■□□□□ 0.32
TY2B-BQ12491 ALG3YBL082C 1377 nt17.05■□□□□ 0.32
TY2B-BQ12491 SPC25YER018C 666 nt17.02■□□□□ 0.32
TY2B-BQ12491 STB1YNL309W 1263 nt17.02■□□□□ 0.32
TY2B-BQ12491 VPS60YDR486C 690 nt17■□□□□ 0.31
TY2B-BQ12491 DAT1YML113W 747 nt17■□□□□ 0.31
TY2B-BQ12491 YNL195CYNL195C 786 nt17■□□□□ 0.31
TY2B-BQ12491 SIM1YIL123W 1431 nt16.99■□□□□ 0.31
TY2B-BQ12491 GPI16YHR188C 1833 nt16.97■□□□□ 0.31
TY2B-BQ12491 NDI1YML120C 1542 nt16.97■□□□□ 0.31
TY2B-BQ12491 DDR2YOL052C-A 186 nt16.94■□□□□ 0.3
TY2B-BQ12491 SPT8YLR055C 1809 nt16.93■□□□□ 0.3
TY2B-BQ12491 RAD51YER095W 1203 nt16.89■□□□□ 0.3
TY2B-BQ12491 SSA4YER103W 1929 nt16.89■□□□□ 0.29
TY2B-BQ12491 RBG1YAL036C 1110 nt16.87■□□□□ 0.29
TY2B-BQ12491 PAU7YAR020C 168 nt16.87■□□□□ 0.29
TY2B-BQ12491 UBA4YHR111W 1323 nt16.85■□□□□ 0.29
TY2B-BQ12491 SHB17YKR043C 816 nt16.85■□□□□ 0.29
TY2B-BQ12491 YFL067WYFL067W 528 nt16.84■□□□□ 0.29
TY2B-BQ12491 YGL034CYGL034C 366 nt16.84■□□□□ 0.29
TY2B-BQ12491 YHL050CYHL050C 2094 nt16.83■□□□□ 0.29
TY2B-BQ12491 CRR1YLR213C 1269 nt16.83■□□□□ 0.28
TY2B-BQ12491 XYL2YLR070C 1071 nt16.79■□□□□ 0.28
TY2B-BQ12491 ERF2YLR246W 1080 nt16.77■□□□□ 0.28
TY2B-BQ12491 MIC10YCL057C-A 294 nt16.76■□□□□ 0.27
TY2B-BQ12491 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt16.75■□□□□ 0.27
TY2B-BQ12491 TIM17YJL143W 477 nt16.75■□□□□ 0.27
TY2B-BQ12491 ANP1YEL036C 1503 nt16.75■□□□□ 0.27
TY2B-BQ12491 YDR010CYDR010C 333 nt16.71■□□□□ 0.27
TY2B-BQ12491 SGT2YOR007C 1041 nt16.7■□□□□ 0.26
TY2B-BQ12491 FEN2YCR028C 1539 nt16.67■□□□□ 0.26
TY2B-BQ12491 SNG1YGR197C 1644 nt16.58■□□□□ 0.24
TY2B-BQ12491 YSR3YKR053C 1215 nt16.58■□□□□ 0.24
TY2B-BQ12491 SHM2YLR058C 1410 nt16.56■□□□□ 0.24
TY2B-BQ12491 AIM45YPR004C 1035 nt16.56■□□□□ 0.24
TY2B-BQ12491 SAM1YLR180W 1149 nt16.52■□□□□ 0.24
TY2B-BQ12491 YIR016WYIR016W 798 nt16.51■□□□□ 0.23
TY2B-BQ12491 PHO89YBR296C 1725 nt16.51■□□□□ 0.23
TY2B-BQ12491 RET2YFR051C 1641 nt16.5■□□□□ 0.23
TY2B-BQ12491 NIT1YIL164C 600 nt16.48■□□□□ 0.23
TY2B-BQ12491 RPM1RPM1 483 nt16.46■□□□□ 0.22
TY2B-BQ12491 XDJ1YLR090W 1380 nt16.45■□□□□ 0.22
TY2B-BQ12491 CAB5YDR196C 726 nt16.43■□□□□ 0.22
TY2B-BQ12491 YNR029CYNR029C 1290 nt16.39■□□□□ 0.21
TY2B-BQ12491 HEM12YDR047W 1089 nt16.38■□□□□ 0.21
TY2B-BQ12491 SDH5YOL071W 489 nt16.38■□□□□ 0.21
TY2B-BQ12491 COQ2YNR041C 1119 nt16.36■□□□□ 0.21
TY2B-BQ12491 YLR111WYLR111W 333 nt16.33■□□□□ 0.21
TY2B-BQ12491 ADH7YCR105W 1086 nt16.32■□□□□ 0.2
TY2B-BQ12491 YCR087WYCR087W 516 nt16.3■□□□□ 0.2
TY2B-BQ12491 LYS4YDR234W 2082 nt16.3■□□□□ 0.2
TY2B-BQ12491 YLR349WYLR349W 507 nt16.27■□□□□ 0.2
TY2B-BQ12491 YLR279WYLR279W 390 nt16.23■□□□□ 0.19
TY2B-BQ12491 YMR226CYMR226C 804 nt16.22■□□□□ 0.19
TY2B-BQ12491 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt16.15■□□□□ 0.18
TY2B-BQ12491 GDH3YAL062W 1374 nt16.15■□□□□ 0.18
TY2B-BQ12491 SFA1YDL168W 1161 nt16.14■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 STE4YOR212W 1272 nt16.13■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 MRP20YDR405W 792 nt16.12■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 PAU15YIR041W 375 nt16.12■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 RPS14BYJL191W 417 nt16.11■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 MIC12YBR262C 321 nt16.11■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 NCP1YHR042W 2076 nt16.11■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 YGR201CYGR201C 678 nt16.1■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt16.1■□□□□ 0.17
TY2B-BQ12491 SEC11YIR022W 504 nt16.04■□□□□ 0.16
TY2B-BQ12491 AVT6YER119C 1347 nt16.04■□□□□ 0.16
TY2B-BQ12491 BNA2YJR078W 1362 nt16.03■□□□□ 0.16
TY2B-BQ12491 PCH2YBR186W 1695 nt15.95■□□□□ 0.14
TY2B-BQ12491 RPL4BYDR012W 1089 nt15.93■□□□□ 0.14
TY2B-BQ12491 RPL4AYBR031W 1089 nt15.93■□□□□ 0.14
TY2B-BQ12491 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt15.92■□□□□ 0.14
TY2B-BQ12491 HHO1YPL127C 777 nt15.91■□□□□ 0.14
TY2B-BQ12491 YGR012WYGR012W 1182 nt15.9■□□□□ 0.14
TY2B-BQ12491 SHH4YLR164W 507 nt15.88■□□□□ 0.13
TY2B-BQ12491 BDF1YLR399C 2061 nt15.86■□□□□ 0.13
TY2B-BQ12491 RAD23YEL037C 1197 nt15.85■□□□□ 0.13
TY2B-BQ12491 FUN14YAL008W 597 nt15.84■□□□□ 0.13
TY2B-BQ12491 TAT1YBR069C 1860 nt15.83■□□□□ 0.12
TY2B-BQ12491 BOP3YNL042W 1191 nt15.82■□□□□ 0.12
TY2B-BQ12491 AGP1YCL025C 1902 nt15.82■□□□□ 0.12
TY2B-BQ12491 DUT1YBR252W 444 nt15.8■□□□□ 0.12
TY2B-BQ12491 RTF1YGL244W 1677 nt15.79■□□□□ 0.12
TY2B-BQ12491 MSB4YOL112W 1479 nt15.78■□□□□ 0.12
TY2B-BQ12491 GPN2YOR262W 1044 nt15.78■□□□□ 0.12
TY2B-BQ12491 PEX2YJL210W 816 nt15.75■□□□□ 0.11
TY2B-BQ12491 GUT2YIL155C 1950 nt15.74■□□□□ 0.11
TY2B-BQ12491 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.74■□□□□ 0.11
TY2B-BQ12491 TSC10YBR265W 963 nt15.73■□□□□ 0.11
TY2B-BQ12491 ADH1YOL086C 1047 nt15.72■□□□□ 0.11
TY2B-BQ12491 TOM6YOR045W 186 nt15.71■□□□□ 0.11
TY2B-BQ12491 NRT1YOR071C 1797 nt15.7■□□□□ 0.1
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