Protein–RNA interactions for Protein: Q12402

YOP1, Protein YOP1, yeastyeast

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOP1Q12402 YLL053CYLL053C 459 nt8.74□□□□□ -1.01
YOP1Q12402 ATF2YGR177C 1608 nt8.73□□□□□ -1.01
YOP1Q12402 YIH1YCR059C 777 nt8.73□□□□□ -1.01
YOP1Q12402 YFL067WYFL067W 528 nt8.72□□□□□ -1.01
YOP1Q12402 DUS1YML080W 1272 nt8.72□□□□□ -1.01
YOP1Q12402 NPP1YCR026C 2229 nt8.71□□□□□ -1.02
YOP1Q12402 YCL074WYCL074W 927 nt8.7□□□□□ -1.02
YOP1Q12402 WHI5YOR083W 888 nt8.69□□□□□ -1.02
YOP1Q12402 BNA2YJR078W 1362 nt8.68□□□□□ -1.02
YOP1Q12402 RNQ1YCL028W 1218 nt8.67□□□□□ -1.02
YOP1Q12402 YCL042WYCL042W 360 nt8.67□□□□□ -1.02
YOP1Q12402 SOR2YDL246C 1074 nt8.66□□□□□ -1.02
YOP1Q12402 SOR1YJR159W 1074 nt8.66□□□□□ -1.02
YOP1Q12402 DDR2YOL052C-A 186 nt8.64□□□□□ -1.03
YOP1Q12402 FTR1YER145C 1215 nt8.62□□□□□ -1.03
YOP1Q12402 TRM5YHR070W 1500 nt8.61□□□□□ -1.03
YOP1Q12402 AGP1YCL025C 1902 nt8.6□□□□□ -1.03
YOP1Q12402 NDI1YML120C 1542 nt8.59□□□□□ -1.03
YOP1Q12402 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.59□□□□□ -1.03
YOP1Q12402 YKL097CYKL097C 411 nt8.59□□□□□ -1.03
YOP1Q12402 YLR281CYLR281C 468 nt8.59□□□□□ -1.03
YOP1Q12402 GAL1YBR020W 1587 nt8.58□□□□□ -1.04
YOP1Q12402 YDR433WYDR433W 441 nt8.58□□□□□ -1.04
YOP1Q12402 IMP2'YIL154C 1041 nt8.58□□□□□ -1.04
YOP1Q12402 MIC12YBR262C 321 nt8.56□□□□□ -1.04
YOP1Q12402 MXR2YCL033C 507 nt8.56□□□□□ -1.04
YOP1Q12402 HHO1YPL127C 777 nt8.54□□□□□ -1.04
YOP1Q12402 ANP1YEL036C 1503 nt8.54□□□□□ -1.04
YOP1Q12402 MAE1YKL029C 2010 nt8.53□□□□□ -1.04
YOP1Q12402 TPO4YOR273C 1980 nt8.48□□□□□ -1.05
YOP1Q12402 DIC1YLR348C 897 nt8.48□□□□□ -1.05
YOP1Q12402 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.47□□□□□ -1.05
YOP1Q12402 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.47□□□□□ -1.05
YOP1Q12402 SPT20YOL148C 1815 nt8.47□□□□□ -1.05
YOP1Q12402 RIM8YGL045W 1629 nt8.47□□□□□ -1.05
YOP1Q12402 HMG2YLR450W 3138 nt8.46□□□□□ -1.05
YOP1Q12402 FMP45YDL222C 930 nt8.46□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 STR3YGL184C 1398 nt8.45□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 FRD1YEL047C 1413 nt8.45□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 AQY1YPR192W 918 nt8.44□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 ESBP6YNL125C 2022 nt8.44□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 UGA4YDL210W 1716 nt8.43□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.43□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 FEN2YCR028C 1539 nt8.43□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 XDJ1YLR090W 1380 nt8.41□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 YGR201CYGR201C 678 nt8.41□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 STB1YNL309W 1263 nt8.41□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 INA1YLR413W 2028 nt8.41□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 AQY2YLL052C 450 nt8.4□□□□□ -1.06
YOP1Q12402 RTN2YDL204W 1182 nt8.39□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 ILV2YMR108W 2064 nt8.39□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 FRE6YLL051C 2139 nt8.38□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 SPC25YER018C 666 nt8.38□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 GPI16YHR188C 1833 nt8.38□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 YIR016WYIR016W 798 nt8.37□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 GDH3YAL062W 1374 nt8.36□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 YKR040CYKR040C 504 nt8.36□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 URA8YJR103W 1737 nt8.36□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 YGL114WYGL114W 2178 nt8.35□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 RPC82YPR190C 1965 nt8.35□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 DUT1YBR252W 444 nt8.34□□□□□ -1.07
YOP1Q12402 ERV46YAL042W 1248 nt8.33□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 PUS2YGL063W 1113 nt8.32□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 UBX6YJL048C 1191 nt8.32□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 YOR139CYOR139C 393 nt8.32□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 DTR1YBR180W 1719 nt8.31□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 BSP1YPR171W 1731 nt8.3□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 VPS60YDR486C 690 nt8.3□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 GOR1YNL274C 1053 nt8.3□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 LPX1YOR084W 1164 nt8.3□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 ACO2YJL200C 2370 nt8.29□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 GTB1YDR221W 2109 nt8.28□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 AVT6YER119C 1347 nt8.28□□□□□ -1.08
YOP1Q12402 YPR011CYPR011C 981 nt8.27□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 HIF1YLL022C 1158 nt8.26□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 CCT4YDL143W 1587 nt8.26□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 GAL2YLR081W 1725 nt8.26□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 SWC5YBR231C 912 nt8.25□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 ALD4YOR374W 1560 nt8.24□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 YLR179CYLR179C 606 nt8.24□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 ALG3YBL082C 1377 nt8.23□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 TIM23YNR017W 669 nt8.22□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 MUP1YGR055W 1725 nt8.22□□□□□ -1.09
YOP1Q12402 THI72YOR192C 1800 nt8.19□□□□□ -1.1
YOP1Q12402 PRM5YIL117C 957 nt8.18□□□□□ -1.1
YOP1Q12402 PTH1YHR189W 573 nt8.17□□□□□ -1.1
YOP1Q12402 PLB1YMR008C 1995 nt8.17□□□□□ -1.1
YOP1Q12402 YLR235CYLR235C 399 nt8.15□□□□□ -1.1
YOP1Q12402 RFC1YOR217W 2586 nt8.14□□□□□ -1.11
YOP1Q12402 AHT1YHR093W 549 nt8.13□□□□□ -1.11
YOP1Q12402 ZRT3YKL175W 1512 nt8.12□□□□□ -1.11
YOP1Q12402 TOK1YJL093C 2076 nt8.11□□□□□ -1.11
YOP1Q12402 HOL1YNR055C 1761 nt8.1□□□□□ -1.11
YOP1Q12402 ARP6YLR085C 1317 nt8.08□□□□□ -1.12
YOP1Q12402 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.06□□□□□ -1.12
YOP1Q12402 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.06□□□□□ -1.12
YOP1Q12402 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.06□□□□□ -1.12
YOP1Q12402 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.06□□□□□ -1.12
YOP1Q12402 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.06□□□□□ -1.12
YOP1Q12402 YPR064WYPR064W 420 nt8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms