Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 RAX1YOR301W 1308 nt9.68□□□□□ -0.86
RTR2Q12378 FRD1YEL047C 1413 nt9.67□□□□□ -0.86
RTR2Q12378 IRC24YIR036C 792 nt9.67□□□□□ -0.86
RTR2Q12378 ERF2YLR246W 1080 nt9.67□□□□□ -0.86
RTR2Q12378 CRR1YLR213C 1269 nt9.65□□□□□ -0.86
RTR2Q12378 WSC2YNL283C 1512 nt9.64□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 NDI1YML120C 1542 nt9.63□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 YGR259CYGR259C 441 nt9.63□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 HUA1YGR268C 597 nt9.62□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 YCL042WYCL042W 360 nt9.62□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 FMT1YBL013W 1206 nt9.61□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 SOR2YDL246C 1074 nt9.6□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 SOR1YJR159W 1074 nt9.6□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 YAT1YAR035W 2064 nt9.6□□□□□ -0.87
RTR2Q12378 HEM12YDR047W 1089 nt9.58□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 SNF6YHL025W 999 nt9.58□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 UBX6YJL048C 1191 nt9.58□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.57□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.57□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 HEL2YDR266C 1920 nt9.57□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 PTH1YHR189W 573 nt9.54□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 YLR235CYLR235C 399 nt9.54□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 MIC10YCL057C-A 294 nt9.54□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 YCL074WYCL074W 927 nt9.53□□□□□ -0.88
RTR2Q12378 YKL030WYKL030W 606 nt9.52□□□□□ -0.89
RTR2Q12378 ADH2YMR303C 1047 nt9.5□□□□□ -0.89
RTR2Q12378 YDR094WYDR094W 336 nt9.49□□□□□ -0.89
RTR2Q12378 CWP1YKL096W 720 nt9.49□□□□□ -0.89
RTR2Q12378 DUS1YML080W 1272 nt9.49□□□□□ -0.89
RTR2Q12378 SPT20YOL148C 1815 nt9.48□□□□□ -0.89
RTR2Q12378 SNG1YGR197C 1644 nt9.47□□□□□ -0.89
RTR2Q12378 ATF2YGR177C 1608 nt9.43□□□□□ -0.9
RTR2Q12378 MET2YNL277W 1461 nt9.43□□□□□ -0.9
RTR2Q12378 YFL067WYFL067W 528 nt9.41□□□□□ -0.9
RTR2Q12378 YIH1YCR059C 777 nt9.4□□□□□ -0.9
RTR2Q12378 YLL053CYLL053C 459 nt9.4□□□□□ -0.9
RTR2Q12378 AGP1YCL025C 1902 nt9.39□□□□□ -0.91
RTR2Q12378 RIM8YGL045W 1629 nt9.38□□□□□ -0.91
RTR2Q12378 BNA2YJR078W 1362 nt9.38□□□□□ -0.91
RTR2Q12378 TIM23YNR017W 669 nt9.37□□□□□ -0.91
RTR2Q12378 DIC1YLR348C 897 nt9.36□□□□□ -0.91
RTR2Q12378 INA1YLR413W 2028 nt9.34□□□□□ -0.91
RTR2Q12378 SFP1YLR403W 2052 nt9.34□□□□□ -0.91
RTR2Q12378 RNQ1YCL028W 1218 nt9.33□□□□□ -0.92
RTR2Q12378 RPC82YPR190C 1965 nt9.32□□□□□ -0.92
RTR2Q12378 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.3□□□□□ -0.92
RTR2Q12378 YLR179CYLR179C 606 nt9.3□□□□□ -0.92
RTR2Q12378 YGL114WYGL114W 2178 nt9.3□□□□□ -0.92
RTR2Q12378 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.29□□□□□ -0.92
RTR2Q12378 DDR2YOL052C-A 186 nt9.29□□□□□ -0.92
RTR2Q12378 MIC12YBR262C 321 nt9.29□□□□□ -0.92
RTR2Q12378 FTR1YER145C 1215 nt9.27□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 YPR064WYPR064W 420 nt9.27□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 NPP1YCR026C 2229 nt9.27□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.26□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.26□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.26□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 TRM5YHR070W 1500 nt9.25□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 YFR018CYFR018C 1092 nt9.24□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 MAE1YKL029C 2010 nt9.24□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 AHT1YHR093W 549 nt9.23□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 TAD3YLR316C 969 nt9.23□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 HHO1YPL127C 777 nt9.23□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 GAL1YBR020W 1587 nt9.23□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 ANP1YEL036C 1503 nt9.22□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 GID7YCL039W 2238 nt9.22□□□□□ -0.93
RTR2Q12378 GPI16YHR188C 1833 nt9.21□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 STR3YGL184C 1398 nt9.21□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 MUP1YGR055W 1725 nt9.2□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 SSN3YPL042C 1668 nt9.2□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 GDH3YAL062W 1374 nt9.18□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 AQY1YPR192W 918 nt9.18□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 RRT5YFR032C 870 nt9.17□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 RTN2YDL204W 1182 nt9.16□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 PAU16YKL224C 372 nt9.16□□□□□ -0.94
RTR2Q12378 XDJ1YLR090W 1380 nt9.14□□□□□ -0.95
RTR2Q12378 PRE6YOL038W 765 nt9.13□□□□□ -0.95
RTR2Q12378 AQY2YLL052C 450 nt9.11□□□□□ -0.95
RTR2Q12378 YGR201CYGR201C 678 nt9.09□□□□□ -0.95
RTR2Q12378 HIF1YLL022C 1158 nt9.08□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 TPO4YOR273C 1980 nt9.07□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 SPC25YER018C 666 nt9.07□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 PEX25YPL112C 1185 nt9.07□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 HMG2YLR450W 3138 nt9.07□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 FEN2YCR028C 1539 nt9.06□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 ACO2YJL200C 2370 nt9.06□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 BDH1YAL060W 1149 nt9.06□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 STB1YNL309W 1263 nt9.06□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 HOL1YNR055C 1761 nt9.06□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 YSP3YOR003W 1437 nt9.05□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 ALD4YOR374W 1560 nt9.04□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 YFL066CYFL066C 1179 nt9.04□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 DUT1YBR252W 444 nt9.04□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 CCT4YDL143W 1587 nt9.03□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.03□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 UGA4YDL210W 1716 nt9.02□□□□□ -0.96
RTR2Q12378 YLR415CYLR415C 339 nt9.02□□□□□ -0.97
RTR2Q12378 YIR016WYIR016W 798 nt9□□□□□ -0.97
RTR2Q12378 YNL115CYNL115C 1935 nt8.99□□□□□ -0.97
RTR2Q12378 VPS60YDR486C 690 nt8.97□□□□□ -0.97
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