Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YFR018CYFR018C 1092 nt12.46□□□□□ -0.41
CLF1Q12309 RRT5YFR032C 870 nt12.45□□□□□ -0.42
CLF1Q12309 BOP3YNL042W 1191 nt12.44□□□□□ -0.42
CLF1Q12309 ATF2YGR177C 1608 nt12.44□□□□□ -0.42
CLF1Q12309 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.42□□□□□ -0.42
CLF1Q12309 GPI16YHR188C 1833 nt12.41□□□□□ -0.42
CLF1Q12309 SPC25YER018C 666 nt12.41□□□□□ -0.42
CLF1Q12309 CRR1YLR213C 1269 nt12.4□□□□□ -0.42
CLF1Q12309 CCT4YDL143W 1587 nt12.39□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 SWC5YBR231C 912 nt12.39□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 RTF1YGL244W 1677 nt12.38□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.38□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 PAU16YKL224C 372 nt12.38□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 YLR415CYLR415C 339 nt12.38□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 NCP1YHR042W 2076 nt12.36□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 HEM12YDR047W 1089 nt12.35□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.35□□□□□ -0.43
CLF1Q12309 BDH1YAL060W 1149 nt12.33□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 PRE6YOL038W 765 nt12.33□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 VPS60YDR486C 690 nt12.31□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 PEX25YPL112C 1185 nt12.31□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 YFL066CYFL066C 1179 nt12.3□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 FEN2YCR028C 1539 nt12.3□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 SNG1YGR197C 1644 nt12.29□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 YSP3YOR003W 1437 nt12.28□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 ANP1YEL036C 1503 nt12.27□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 YNL115CYNL115C 1935 nt12.27□□□□□ -0.44
CLF1Q12309 LYS4YDR234W 2082 nt12.25□□□□□ -0.45
CLF1Q12309 MIC10YCL057C-A 294 nt12.24□□□□□ -0.45
CLF1Q12309 ALG3YBL082C 1377 nt12.22□□□□□ -0.45
CLF1Q12309 PIB2YGL023C 1908 nt12.21□□□□□ -0.46
CLF1Q12309 YIR016WYIR016W 798 nt12.18□□□□□ -0.46
CLF1Q12309 BNA2YJR078W 1362 nt12.17□□□□□ -0.46
CLF1Q12309 GLK1YCL040W 1503 nt12.16□□□□□ -0.46
CLF1Q12309 NAT4YMR069W 858 nt12.15□□□□□ -0.46
CLF1Q12309 VPS75YNL246W 795 nt12.13□□□□□ -0.47
CLF1Q12309 SPT8YLR055C 1809 nt12.13□□□□□ -0.47
CLF1Q12309 PTK1YKL198C 1989 nt12.11□□□□□ -0.47
CLF1Q12309 TIM17YJL143W 477 nt12.1□□□□□ -0.47
CLF1Q12309 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.09□□□□□ -0.47
CLF1Q12309 PAU7YAR020C 168 nt12.08□□□□□ -0.48
CLF1Q12309 RAX1YOR301W 1308 nt12.08□□□□□ -0.48
CLF1Q12309 YFL054CYFL054C 1941 nt12.05□□□□□ -0.48
CLF1Q12309 THI74YDR438W 1113 nt12.01□□□□□ -0.49
CLF1Q12309 XDJ1YLR090W 1380 nt12□□□□□ -0.49
CLF1Q12309 MIR1YJR077C 936 nt11.99□□□□□ -0.49
CLF1Q12309 MSF1YPR047W 1410 nt11.99□□□□□ -0.49
CLF1Q12309 SHM2YLR058C 1410 nt11.98□□□□□ -0.49
CLF1Q12309 HHO1YPL127C 777 nt11.98□□□□□ -0.49
CLF1Q12309 MIC12YBR262C 321 nt11.98□□□□□ -0.49
CLF1Q12309 UME6YDR207C 2511 nt11.98□□□□□ -0.49
CLF1Q12309 GDH3YAL062W 1374 nt11.95□□□□□ -0.5
CLF1Q12309 SBA1YKL117W 651 nt11.95□□□□□ -0.5
CLF1Q12309 YGR201CYGR201C 678 nt11.92□□□□□ -0.5
CLF1Q12309 SGT2YOR007C 1041 nt11.88□□□□□ -0.51
CLF1Q12309 DAT1YML113W 747 nt11.86□□□□□ -0.51
CLF1Q12309 AVT6YER119C 1347 nt11.86□□□□□ -0.51
CLF1Q12309 SHB17YKR043C 816 nt11.85□□□□□ -0.51
CLF1Q12309 UBA4YHR111W 1323 nt11.84□□□□□ -0.51
CLF1Q12309 GOR1YNL274C 1053 nt11.83□□□□□ -0.52
CLF1Q12309 RPM1RPM1 483 nt11.82□□□□□ -0.52
CLF1Q12309 NIT1YIL164C 600 nt11.81□□□□□ -0.52
CLF1Q12309 YSR3YKR053C 1215 nt11.81□□□□□ -0.52
CLF1Q12309 YJL225CYJL225C 5277 nt11.78□□□□□ -0.52
CLF1Q12309 YGL034CYGL034C 366 nt11.78□□□□□ -0.52
CLF1Q12309 CCA1YER168C 1641 nt11.76□□□□□ -0.53
CLF1Q12309 YDR010CYDR010C 333 nt11.73□□□□□ -0.53
CLF1Q12309 SWE1YJL187C 2460 nt11.73□□□□□ -0.53
CLF1Q12309 PHO89YBR296C 1725 nt11.72□□□□□ -0.53
CLF1Q12309 YCR087WYCR087W 516 nt11.7□□□□□ -0.54
CLF1Q12309 XYL2YLR070C 1071 nt11.7□□□□□ -0.54
CLF1Q12309 YCR102CYCR102C 1107 nt11.69□□□□□ -0.54
CLF1Q12309 DUS1YML080W 1272 nt11.69□□□□□ -0.54
CLF1Q12309 RET2YFR051C 1641 nt11.68□□□□□ -0.54
CLF1Q12309 AGP1YCL025C 1902 nt11.66□□□□□ -0.54
CLF1Q12309 NDI1YML120C 1542 nt11.66□□□□□ -0.54
CLF1Q12309 RBG1YAL036C 1110 nt11.66□□□□□ -0.54
CLF1Q12309 DUT1YBR252W 444 nt11.64□□□□□ -0.55
CLF1Q12309 GLR1YPL091W 1452 nt11.63□□□□□ -0.55
CLF1Q12309 MRP20YDR405W 792 nt11.62□□□□□ -0.55
CLF1Q12309 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.62□□□□□ -0.55
CLF1Q12309 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.62□□□□□ -0.55
CLF1Q12309 YMR244WYMR244W 1068 nt11.59□□□□□ -0.55
CLF1Q12309 AIM45YPR004C 1035 nt11.59□□□□□ -0.55
CLF1Q12309 AQY2YLL052C 450 nt11.54□□□□□ -0.56
CLF1Q12309 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.53□□□□□ -0.56
CLF1Q12309 COQ2YNR041C 1119 nt11.51□□□□□ -0.57
CLF1Q12309 YCL074WYCL074W 927 nt11.5□□□□□ -0.57
CLF1Q12309 SFA1YDL168W 1161 nt11.49□□□□□ -0.57
CLF1Q12309 NBP35YGL091C 987 nt11.48□□□□□ -0.57
CLF1Q12309 STR3YGL184C 1398 nt11.47□□□□□ -0.57
CLF1Q12309 TIR3YIL011W 810 nt11.46□□□□□ -0.57
CLF1Q12309 CLB6YGR109C 1143 nt11.45□□□□□ -0.58
CLF1Q12309 RPL4BYDR012W 1089 nt11.44□□□□□ -0.58
CLF1Q12309 RPL4AYBR031W 1089 nt11.44□□□□□ -0.58
CLF1Q12309 BOR1YNL275W 1731 nt11.43□□□□□ -0.58
CLF1Q12309 RBG2YGR173W 1107 nt11.41□□□□□ -0.58
CLF1Q12309 YMR226CYMR226C 804 nt11.4□□□□□ -0.58
CLF1Q12309 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.39□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.39□□□□□ -0.59
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