Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.92□□□□□ -0.98
YPS3Q12303 PTH1YHR189W 573 nt8.92□□□□□ -0.98
YPS3Q12303 BNA2YJR078W 1362 nt8.9□□□□□ -0.98
YPS3Q12303 GLK1YCL040W 1503 nt8.9□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 YLR235CYLR235C 399 nt8.89□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 AQY1YPR192W 918 nt8.89□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 CCA1YER168C 1641 nt8.89□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 FUR4YBR021W 1902 nt8.86□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 YLR179CYLR179C 606 nt8.86□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 TIM23YNR017W 669 nt8.86□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.85□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 ANP1YEL036C 1503 nt8.85□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 STB1YNL309W 1263 nt8.84□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 SPP1YPL138C 1062 nt8.84□□□□□ -0.99
YPS3Q12303 FEN2YCR028C 1539 nt8.8□□□□□ -1
YPS3Q12303 GPI16YHR188C 1833 nt8.8□□□□□ -1
YPS3Q12303 SPC25YER018C 666 nt8.8□□□□□ -1
YPS3Q12303 DUS1YML080W 1272 nt8.78□□□□□ -1
YPS3Q12303 HHO1YPL127C 777 nt8.76□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 PRP4YPR178W 1398 nt8.75□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 YKL030WYKL030W 606 nt8.75□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 MIC12YBR262C 321 nt8.75□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 CCT4YDL143W 1587 nt8.73□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 VPS60YDR486C 690 nt8.73□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.73□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 YEL076CYEL076C 651 nt8.73□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 YIR016WYIR016W 798 nt8.73□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 YLR464WYLR464W 651 nt8.73□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 SWC5YBR231C 912 nt8.73□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 BMT6YLR063W 1098 nt8.72□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 YPR064WYPR064W 420 nt8.72□□□□□ -1.01
YPS3Q12303 AHT1YHR093W 549 nt8.71□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 WSC2YNL283C 1512 nt8.7□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 ALG12YNR030W 1656 nt8.69□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 DPS1YLL018C 1674 nt8.69□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 AGP1YCL025C 1902 nt8.68□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 YCL074WYCL074W 927 nt8.68□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 AAC1YMR056C 930 nt8.68□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 ALG3YBL082C 1377 nt8.66□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 YGR201CYGR201C 678 nt8.66□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 YKR005CYKR005C 1578 nt8.65□□□□□ -1.02
YPS3Q12303 TAD3YLR316C 969 nt8.63□□□□□ -1.03
YPS3Q12303 YGR259CYGR259C 441 nt8.6□□□□□ -1.03
YPS3Q12303 RPM1RPM1 483 nt8.6□□□□□ -1.03
YPS3Q12303 AVT6YER119C 1347 nt8.58□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 MCH5YOR306C 1566 nt8.58□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 GOR1YNL274C 1053 nt8.58□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 XDJ1YLR090W 1380 nt8.57□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 GDH3YAL062W 1374 nt8.56□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 AQY2YLL052C 450 nt8.54□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 STR3YGL184C 1398 nt8.53□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 YLR415CYLR415C 339 nt8.53□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 DUT1YBR252W 444 nt8.53□□□□□ -1.04
YPS3Q12303 IRC24YIR036C 792 nt8.52□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.52□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.52□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 RTG1YOL067C 534 nt8.51□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.5□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 SNF1YDR477W 1902 nt8.5□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 BDH1YAL060W 1149 nt8.49□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 NAR1YNL240C 1476 nt8.49□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 TIM17YJL143W 477 nt8.48□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 BIO5YNR056C 1686 nt8.47□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 SHM2YLR058C 1410 nt8.46□□□□□ -1.05
YPS3Q12303 HUA1YGR268C 597 nt8.46□□□□□ -1.06
YPS3Q12303 RTN2YDL204W 1182 nt8.43□□□□□ -1.06
YPS3Q12303 YSP3YOR003W 1437 nt8.37□□□□□ -1.07
YPS3Q12303 YCR102CYCR102C 1107 nt8.35□□□□□ -1.07
YPS3Q12303 CYT2YKL087C 675 nt8.35□□□□□ -1.07
YPS3Q12303 DAT1YML113W 747 nt8.35□□□□□ -1.07
YPS3Q12303 PBP1YGR178C 2169 nt8.34□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 NIT1YIL164C 600 nt8.33□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 SGT2YOR007C 1041 nt8.33□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 YNL115CYNL115C 1935 nt8.33□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 ADO1YJR105W 1023 nt8.32□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 MRPL8YJL063C 717 nt8.29□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 PEX25YPL112C 1185 nt8.29□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 NBP35YGL091C 987 nt8.28□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 PLB1YMR008C 1995 nt8.28□□□□□ -1.08
YPS3Q12303 VPS75YNL246W 795 nt8.25□□□□□ -1.09
YPS3Q12303 ARP6YLR085C 1317 nt8.24□□□□□ -1.09
YPS3Q12303 YFL066CYFL066C 1179 nt8.23□□□□□ -1.09
YPS3Q12303 PAU7YAR020C 168 nt8.22□□□□□ -1.09
YPS3Q12303 PRM5YIL117C 957 nt8.19□□□□□ -1.1
YPS3Q12303 ALD4YOR374W 1560 nt8.18□□□□□ -1.1
YPS3Q12303 CMP2YML057W 1815 nt8.17□□□□□ -1.1
YPS3Q12303 TIR3YIL011W 810 nt8.17□□□□□ -1.1
YPS3Q12303 HIF1YLL022C 1158 nt8.17□□□□□ -1.1
YPS3Q12303 SAM35YHR083W 990 nt8.16□□□□□ -1.1
YPS3Q12303 LSC2YGR244C 1284 nt8.15□□□□□ -1.1
YPS3Q12303 GAP1YKR039W 1809 nt8.15□□□□□ -1.11
YPS3Q12303 YFR018CYFR018C 1092 nt8.14□□□□□ -1.11
YPS3Q12303 UTR1YJR049C 1593 nt8.14□□□□□ -1.11
YPS3Q12303 YAT1YAR035W 2064 nt8.13□□□□□ -1.11
YPS3Q12303 PRO1YDR300C 1287 nt8.11□□□□□ -1.11
YPS3Q12303 SHH4YLR164W 507 nt8.1□□□□□ -1.11
YPS3Q12303 ATG15YCR068W 1563 nt8.1□□□□□ -1.11
YPS3Q12303 NDI1YML120C 1542 nt8.09□□□□□ -1.11
YPS3Q12303 INA1YLR413W 2028 nt8.07□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms