Protein–RNA interactions for Protein: Q12254

SVS1, Protein SVS1, yeastyeast

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVS1Q12254 NCP1YHR042W 2076 nt11.21□□□□□ -0.61
SVS1Q12254 ATF2YGR177C 1608 nt11.21□□□□□ -0.61
SVS1Q12254 STB1YNL309W 1263 nt11.21□□□□□ -0.61
SVS1Q12254 SPC25YER018C 666 nt11.2□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 BOP3YNL042W 1191 nt11.2□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 RRT5YFR032C 870 nt11.19□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 CRR1YLR213C 1269 nt11.19□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.18□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.18□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 GPI16YHR188C 1833 nt11.18□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 RTF1YGL244W 1677 nt11.17□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 CCT4YDL143W 1587 nt11.16□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.15□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 PAU16YKL224C 372 nt11.15□□□□□ -0.62
SVS1Q12254 BDH1YAL060W 1149 nt11.13□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 YLR415CYLR415C 339 nt11.13□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 PRE6YOL038W 765 nt11.12□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 PEX25YPL112C 1185 nt11.11□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 SWC5YBR231C 912 nt11.11□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 HEM12YDR047W 1089 nt11.1□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 LYS4YDR234W 2082 nt11.1□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 YSP3YOR003W 1437 nt11.09□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 VPS60YDR486C 690 nt11.09□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 ANP1YEL036C 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
SVS1Q12254 PIB2YGL023C 1908 nt11.08□□□□□ -0.64
SVS1Q12254 FEN2YCR028C 1539 nt11.08□□□□□ -0.64
SVS1Q12254 SNG1YGR197C 1644 nt11.07□□□□□ -0.64
SVS1Q12254 YFL066CYFL066C 1179 nt11.06□□□□□ -0.64
SVS1Q12254 YNL115CYNL115C 1935 nt11.05□□□□□ -0.64
SVS1Q12254 MIC10YCL057C-A 294 nt11.03□□□□□ -0.64
SVS1Q12254 ALG3YBL082C 1377 nt11.02□□□□□ -0.65
SVS1Q12254 YJL225CYJL225C 5277 nt10.97□□□□□ -0.65
SVS1Q12254 YIR016WYIR016W 798 nt10.96□□□□□ -0.65
SVS1Q12254 PTK1YKL198C 1989 nt10.96□□□□□ -0.66
SVS1Q12254 SPT8YLR055C 1809 nt10.94□□□□□ -0.66
SVS1Q12254 VPS75YNL246W 795 nt10.93□□□□□ -0.66
SVS1Q12254 NAT4YMR069W 858 nt10.91□□□□□ -0.66
SVS1Q12254 BNA2YJR078W 1362 nt10.9□□□□□ -0.66
SVS1Q12254 GLK1YCL040W 1503 nt10.9□□□□□ -0.66
SVS1Q12254 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.9□□□□□ -0.66
SVS1Q12254 NME1NME1 340 nt10.88□□□□□ -0.67
SVS1Q12254 TIM17YJL143W 477 nt10.87□□□□□ -0.67
SVS1Q12254 RAX1YOR301W 1308 nt10.85□□□□□ -0.67
SVS1Q12254 MIR1YJR077C 936 nt10.83□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 MIC12YBR262C 321 nt10.83□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 YFL054CYFL054C 1941 nt10.83□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 THI74YDR438W 1113 nt10.81□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 PAU7YAR020C 168 nt10.81□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 XDJ1YLR090W 1380 nt10.8□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 MSF1YPR047W 1410 nt10.8□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 SHM2YLR058C 1410 nt10.78□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 SBA1YKL117W 651 nt10.78□□□□□ -0.68
SVS1Q12254 YGR201CYGR201C 678 nt10.75□□□□□ -0.69
SVS1Q12254 HHO1YPL127C 777 nt10.75□□□□□ -0.69
SVS1Q12254 GDH3YAL062W 1374 nt10.74□□□□□ -0.69
SVS1Q12254 YGR139WYGR139W 339 nt10.7□□□□□ -0.7
SVS1Q12254 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.7□□□□□ -0.7
SVS1Q12254 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.7□□□□□ -0.7
SVS1Q12254 DAT1YML113W 747 nt10.68□□□□□ -0.7
SVS1Q12254 SGT2YOR007C 1041 nt10.68□□□□□ -0.7
SVS1Q12254 NIT1YIL164C 600 nt10.67□□□□□ -0.7
SVS1Q12254 SHB17YKR043C 816 nt10.66□□□□□ -0.7
SVS1Q12254 UBA4YHR111W 1323 nt10.65□□□□□ -0.7
SVS1Q12254 AVT6YER119C 1347 nt10.64□□□□□ -0.71
SVS1Q12254 UME6YDR207C 2511 nt10.62□□□□□ -0.71
SVS1Q12254 GOR1YNL274C 1053 nt10.61□□□□□ -0.71
SVS1Q12254 CCA1YER168C 1641 nt10.6□□□□□ -0.71
SVS1Q12254 YGL034CYGL034C 366 nt10.6□□□□□ -0.71
SVS1Q12254 YSR3YKR053C 1215 nt10.6□□□□□ -0.71
SVS1Q12254 YDR010CYDR010C 333 nt10.59□□□□□ -0.71
SVS1Q12254 SWE1YJL187C 2460 nt10.59□□□□□ -0.71
SVS1Q12254 RET2YFR051C 1641 nt10.55□□□□□ -0.72
SVS1Q12254 AGP1YCL025C 1902 nt10.54□□□□□ -0.72
SVS1Q12254 YCR087WYCR087W 516 nt10.53□□□□□ -0.72
SVS1Q12254 PHO89YBR296C 1725 nt10.52□□□□□ -0.73
SVS1Q12254 YCR102CYCR102C 1107 nt10.51□□□□□ -0.73
SVS1Q12254 XYL2YLR070C 1071 nt10.51□□□□□ -0.73
SVS1Q12254 DUT1YBR252W 444 nt10.48□□□□□ -0.73
SVS1Q12254 GLR1YPL091W 1452 nt10.47□□□□□ -0.73
SVS1Q12254 NDI1YML120C 1542 nt10.47□□□□□ -0.73
SVS1Q12254 RBG1YAL036C 1110 nt10.46□□□□□ -0.73
SVS1Q12254 DUS1YML080W 1272 nt10.45□□□□□ -0.74
SVS1Q12254 YMR244WYMR244W 1068 nt10.45□□□□□ -0.74
SVS1Q12254 AIM45YPR004C 1035 nt10.44□□□□□ -0.74
SVS1Q12254 MRP20YDR405W 792 nt10.42□□□□□ -0.74
SVS1Q12254 SFA1YDL168W 1161 nt10.37□□□□□ -0.75
SVS1Q12254 COQ2YNR041C 1119 nt10.37□□□□□ -0.75
SVS1Q12254 BOR1YNL275W 1731 nt10.36□□□□□ -0.75
SVS1Q12254 NBP35YGL091C 987 nt10.36□□□□□ -0.75
SVS1Q12254 YCL074WYCL074W 927 nt10.35□□□□□ -0.75
SVS1Q12254 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.35□□□□□ -0.75
SVS1Q12254 TIR3YIL011W 810 nt10.34□□□□□ -0.75
SVS1Q12254 AQY2YLL052C 450 nt10.33□□□□□ -0.76
SVS1Q12254 STR3YGL184C 1398 nt10.33□□□□□ -0.76
SVS1Q12254 RPL4BYDR012W 1089 nt10.29□□□□□ -0.76
SVS1Q12254 RBG2YGR173W 1107 nt10.29□□□□□ -0.76
SVS1Q12254 RPL4AYBR031W 1089 nt10.29□□□□□ -0.76
SVS1Q12254 CLB6YGR109C 1143 nt10.28□□□□□ -0.76
SVS1Q12254 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
SVS1Q12254 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms