Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.12□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 ATF2YGR177C 1608 nt10.11□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 YLL053CYLL053C 459 nt10.09□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 YFL067WYFL067W 528 nt10.07□□□□□ -0.8
MSH5Q12175 YIH1YCR059C 777 nt10.06□□□□□ -0.8
MSH5Q12175 YLR281CYLR281C 468 nt10.06□□□□□ -0.8
MSH5Q12175 SPT20YOL148C 1815 nt10.05□□□□□ -0.8
MSH5Q12175 AGP1YCL025C 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
MSH5Q12175 IMP2'YIL154C 1041 nt10.03□□□□□ -0.8
MSH5Q12175 BNA2YJR078W 1362 nt10.02□□□□□ -0.8
MSH5Q12175 RNQ1YCL028W 1218 nt9.98□□□□□ -0.81
MSH5Q12175 YDR433WYDR433W 441 nt9.95□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 DDR2YOL052C-A 186 nt9.95□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 RIM8YGL045W 1629 nt9.95□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 FTR1YER145C 1215 nt9.94□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 YCL042WYCL042W 360 nt9.94□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 SOR2YDL246C 1074 nt9.93□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 SOR1YJR159W 1074 nt9.93□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 MIC12YBR262C 321 nt9.93□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 MXR2YCL033C 507 nt9.93□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 TRM5YHR070W 1500 nt9.92□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 INA1YLR413W 2028 nt9.92□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.92□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 YOR139CYOR139C 393 nt9.91□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 RPC82YPR190C 1965 nt9.91□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 GAL1YBR020W 1587 nt9.9□□□□□ -0.82
MSH5Q12175 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.89□□□□□ -0.83
MSH5Q12175 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.89□□□□□ -0.83
MSH5Q12175 HHO1YPL127C 777 nt9.89□□□□□ -0.83
MSH5Q12175 ANP1YEL036C 1503 nt9.87□□□□□ -0.83
MSH5Q12175 YGL114WYGL114W 2178 nt9.85□□□□□ -0.83
MSH5Q12175 STR3YGL184C 1398 nt9.85□□□□□ -0.83
MSH5Q12175 FMP45YDL222C 930 nt9.84□□□□□ -0.83
MSH5Q12175 GDH3YAL062W 1374 nt9.79□□□□□ -0.84
MSH5Q12175 PUS2YGL063W 1113 nt9.79□□□□□ -0.84
MSH5Q12175 XDJ1YLR090W 1380 nt9.78□□□□□ -0.84
MSH5Q12175 FRD1YEL047C 1413 nt9.78□□□□□ -0.84
MSH5Q12175 MUP1YGR055W 1725 nt9.78□□□□□ -0.84
MSH5Q12175 MAE1YKL029C 2010 nt9.78□□□□□ -0.84
MSH5Q12175 GPI16YHR188C 1833 nt9.76□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 MET2YNL277W 1461 nt9.75□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 RTN2YDL204W 1182 nt9.75□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 YPR011CYPR011C 981 nt9.75□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 AQY2YLL052C 450 nt9.74□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 LPX1YOR084W 1164 nt9.74□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 YGR201CYGR201C 678 nt9.72□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 YKR040CYKR040C 504 nt9.72□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 DIC1YLR348C 897 nt9.72□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 FEN2YCR028C 1539 nt9.72□□□□□ -0.85
MSH5Q12175 ERV46YAL042W 1248 nt9.7□□□□□ -0.86
MSH5Q12175 DUT1YBR252W 444 nt9.7□□□□□ -0.86
MSH5Q12175 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.69□□□□□ -0.86
MSH5Q12175 HIF1YLL022C 1158 nt9.69□□□□□ -0.86
MSH5Q12175 AQY1YPR192W 918 nt9.68□□□□□ -0.86
MSH5Q12175 STB1YNL309W 1263 nt9.67□□□□□ -0.86
MSH5Q12175 YIR016WYIR016W 798 nt9.66□□□□□ -0.86
MSH5Q12175 SPC25YER018C 666 nt9.64□□□□□ -0.87
MSH5Q12175 ALD4YOR374W 1560 nt9.63□□□□□ -0.87
MSH5Q12175 HOL1YNR055C 1761 nt9.63□□□□□ -0.87
MSH5Q12175 SFP1YLR403W 2052 nt9.6□□□□□ -0.87
MSH5Q12175 ACO2YJL200C 2370 nt9.59□□□□□ -0.87
MSH5Q12175 GOR1YNL274C 1053 nt9.59□□□□□ -0.87
MSH5Q12175 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.58□□□□□ -0.88
MSH5Q12175 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.58□□□□□ -0.88
MSH5Q12175 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.58□□□□□ -0.88
MSH5Q12175 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.58□□□□□ -0.88
MSH5Q12175 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.58□□□□□ -0.88
MSH5Q12175 PRM5YIL117C 957 nt9.55□□□□□ -0.88
MSH5Q12175 AVT6YER119C 1347 nt9.55□□□□□ -0.88
MSH5Q12175 VPS60YDR486C 690 nt9.54□□□□□ -0.88
MSH5Q12175 PLB1YMR008C 1995 nt9.52□□□□□ -0.89
MSH5Q12175 ZRT3YKL175W 1512 nt9.51□□□□□ -0.89
MSH5Q12175 PTH1YHR189W 573 nt9.5□□□□□ -0.89
MSH5Q12175 YMR209CYMR209C 1374 nt9.5□□□□□ -0.89
MSH5Q12175 YLR179CYLR179C 606 nt9.49□□□□□ -0.89
MSH5Q12175 TIM23YNR017W 669 nt9.48□□□□□ -0.89
MSH5Q12175 CCT4YDL143W 1587 nt9.48□□□□□ -0.89
MSH5Q12175 ALG3YBL082C 1377 nt9.48□□□□□ -0.89
MSH5Q12175 YNL024CYNL024C 741 nt9.46□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 SWC5YBR231C 912 nt9.44□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 YLR235CYLR235C 399 nt9.43□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 UGA4YDL210W 1716 nt9.42□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 TPO4YOR273C 1980 nt9.42□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 YJL067WYJL067W 351 nt9.41□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 HMG2YLR450W 3138 nt9.4□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 ILV3YJR016C 1758 nt9.4□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 HIS2YFR025C 1008 nt9.4□□□□□ -0.9
MSH5Q12175 SSN3YPL042C 1668 nt9.39□□□□□ -0.91
MSH5Q12175 NPP1YCR026C 2229 nt9.39□□□□□ -0.91
MSH5Q12175 ARP6YLR085C 1317 nt9.39□□□□□ -0.91
MSH5Q12175 AHT1YHR093W 549 nt9.37□□□□□ -0.91
MSH5Q12175 YOR325WYOR325W 474 nt9.35□□□□□ -0.91
MSH5Q12175 YHL008CYHL008C 1884 nt9.34□□□□□ -0.91
MSH5Q12175 UGP1YKL035W 1500 nt9.33□□□□□ -0.92
MSH5Q12175 UTR1YJR049C 1593 nt9.33□□□□□ -0.92
MSH5Q12175 COQ8YGL119W 1506 nt9.31□□□□□ -0.92
MSH5Q12175 PSD1YNL169C 1503 nt9.31□□□□□ -0.92
MSH5Q12175 SAM35YHR083W 990 nt9.3□□□□□ -0.92
MSH5Q12175 SPP1YPL138C 1062 nt9.29□□□□□ -0.92
MSH5Q12175 YPR064WYPR064W 420 nt9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.5 ms