Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 SIM1YIL123W 1431 nt14.16□□□□□ -0.14
SLM3Q12093 SSA4YER103W 1929 nt14.13□□□□□ -0.15
SLM3Q12093 THI74YDR438W 1113 nt14.13□□□□□ -0.15
SLM3Q12093 MIR1YJR077C 936 nt14.12□□□□□ -0.15
SLM3Q12093 STB1YNL309W 1263 nt14.12□□□□□ -0.15
SLM3Q12093 CCT4YDL143W 1587 nt14.11□□□□□ -0.15
SLM3Q12093 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt14.07□□□□□ -0.16
SLM3Q12093 SPC25YER018C 666 nt14.07□□□□□ -0.16
SLM3Q12093 YMR244WYMR244W 1068 nt14.07□□□□□ -0.16
SLM3Q12093 SWC5YBR231C 912 nt14.03□□□□□ -0.16
SLM3Q12093 GPI16YHR188C 1833 nt14.01□□□□□ -0.17
SLM3Q12093 ATF2YGR177C 1608 nt14.01□□□□□ -0.17
SLM3Q12093 VPS75YNL246W 795 nt14.01□□□□□ -0.17
SLM3Q12093 DDR2YOL052C-A 186 nt14.01□□□□□ -0.17
SLM3Q12093 VPS60YDR486C 690 nt14□□□□□ -0.17
SLM3Q12093 YHL050CYHL050C 2094 nt13.99□□□□□ -0.17
SLM3Q12093 DAT1YML113W 747 nt13.96□□□□□ -0.17
SLM3Q12093 ALG3YBL082C 1377 nt13.96□□□□□ -0.18
SLM3Q12093 YFL067WYFL067W 528 nt13.93□□□□□ -0.18
SLM3Q12093 GLR1YPL091W 1452 nt13.92□□□□□ -0.18
SLM3Q12093 SPT8YLR055C 1809 nt13.9□□□□□ -0.18
SLM3Q12093 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.9□□□□□ -0.18
SLM3Q12093 FEN2YCR028C 1539 nt13.9□□□□□ -0.19
SLM3Q12093 PAU7YAR020C 168 nt13.89□□□□□ -0.19
SLM3Q12093 ERF2YLR246W 1080 nt13.89□□□□□ -0.19
SLM3Q12093 YGL034CYGL034C 366 nt13.86□□□□□ -0.19
SLM3Q12093 ANP1YEL036C 1503 nt13.82□□□□□ -0.2
SLM3Q12093 CRR1YLR213C 1269 nt13.82□□□□□ -0.2
SLM3Q12093 UBA4YHR111W 1323 nt13.81□□□□□ -0.2
SLM3Q12093 RBG2YGR173W 1107 nt13.78□□□□□ -0.2
SLM3Q12093 NDI1YML120C 1542 nt13.77□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 SHB17YKR043C 816 nt13.76□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 SNG1YGR197C 1644 nt13.75□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 YIR016WYIR016W 798 nt13.75□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 TIM17YJL143W 477 nt13.75□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 YSR3YKR053C 1215 nt13.74□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 RBG1YAL036C 1110 nt13.73□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 XYL2YLR070C 1071 nt13.72□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 MIC10YCL057C-A 294 nt13.72□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 HEM12YDR047W 1089 nt13.71□□□□□ -0.21
SLM3Q12093 SHM2YLR058C 1410 nt13.65□□□□□ -0.22
SLM3Q12093 YDR010CYDR010C 333 nt13.63□□□□□ -0.23
SLM3Q12093 SEC11YIR022W 504 nt13.62□□□□□ -0.23
SLM3Q12093 LYS4YDR234W 2082 nt13.6□□□□□ -0.23
SLM3Q12093 NCP1YHR042W 2076 nt13.58□□□□□ -0.24
SLM3Q12093 SGT2YOR007C 1041 nt13.57□□□□□ -0.24
SLM3Q12093 XDJ1YLR090W 1380 nt13.57□□□□□ -0.24
SLM3Q12093 PHO89YBR296C 1725 nt13.56□□□□□ -0.24
SLM3Q12093 NIT1YIL164C 600 nt13.52□□□□□ -0.25
SLM3Q12093 RET2YFR051C 1641 nt13.5□□□□□ -0.25
SLM3Q12093 AIM45YPR004C 1035 nt13.49□□□□□ -0.25
SLM3Q12093 YCR087WYCR087W 516 nt13.48□□□□□ -0.25
SLM3Q12093 YMR226CYMR226C 804 nt13.48□□□□□ -0.25
SLM3Q12093 GDH3YAL062W 1374 nt13.47□□□□□ -0.25
SLM3Q12093 BDF1YLR399C 2061 nt13.47□□□□□ -0.25
SLM3Q12093 PCH2YBR186W 1695 nt13.47□□□□□ -0.25
SLM3Q12093 BNA2YJR078W 1362 nt13.45□□□□□ -0.26
SLM3Q12093 SAM1YLR180W 1149 nt13.43□□□□□ -0.26
SLM3Q12093 MRP20YDR405W 792 nt13.38□□□□□ -0.27
SLM3Q12093 MIC12YBR262C 321 nt13.37□□□□□ -0.27
SLM3Q12093 GUT2YIL155C 1950 nt13.35□□□□□ -0.27
SLM3Q12093 BOP3YNL042W 1191 nt13.35□□□□□ -0.27
SLM3Q12093 COQ2YNR041C 1119 nt13.35□□□□□ -0.27
SLM3Q12093 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.34□□□□□ -0.27
SLM3Q12093 YLR111WYLR111W 333 nt13.32□□□□□ -0.28
SLM3Q12093 RAD51YER095W 1203 nt13.31□□□□□ -0.28
SLM3Q12093 HHO1YPL127C 777 nt13.31□□□□□ -0.28
SLM3Q12093 TAT1YBR069C 1860 nt13.31□□□□□ -0.28
SLM3Q12093 RTF1YGL244W 1677 nt13.29□□□□□ -0.28
SLM3Q12093 AVT6YER119C 1347 nt13.28□□□□□ -0.28
SLM3Q12093 RAX1YOR301W 1308 nt13.27□□□□□ -0.29
SLM3Q12093 YGR201CYGR201C 678 nt13.26□□□□□ -0.29
SLM3Q12093 SFA1YDL168W 1161 nt13.25□□□□□ -0.29
SLM3Q12093 PIB2YGL023C 1908 nt13.19□□□□□ -0.3
SLM3Q12093 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt13.19□□□□□ -0.3
SLM3Q12093 RPM1RPM1 483 nt13.19□□□□□ -0.3
SLM3Q12093 SDH5YOL071W 489 nt13.19□□□□□ -0.3
SLM3Q12093 GOR1YNL274C 1053 nt13.16□□□□□ -0.3
SLM3Q12093 RPL4BYDR012W 1089 nt13.15□□□□□ -0.3
SLM3Q12093 RPL4AYBR031W 1089 nt13.15□□□□□ -0.3
SLM3Q12093 YCR102CYCR102C 1107 nt13.14□□□□□ -0.31
SLM3Q12093 DUT1YBR252W 444 nt13.13□□□□□ -0.31
SLM3Q12093 YNR029CYNR029C 1290 nt13.11□□□□□ -0.31
SLM3Q12093 RPS14BYJL191W 417 nt13.09□□□□□ -0.31
SLM3Q12093 PTK1YKL198C 1989 nt13.09□□□□□ -0.31
SLM3Q12093 STE4YOR212W 1272 nt13.07□□□□□ -0.32
SLM3Q12093 CAB5YDR196C 726 nt13.06□□□□□ -0.32
SLM3Q12093 RAD23YEL037C 1197 nt13.06□□□□□ -0.32
SLM3Q12093 CLB6YGR109C 1143 nt13.06□□□□□ -0.32
SLM3Q12093 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.06□□□□□ -0.32
SLM3Q12093 SHH4YLR164W 507 nt13.04□□□□□ -0.32
SLM3Q12093 AGP1YCL025C 1902 nt13.02□□□□□ -0.32
SLM3Q12093 YLR349WYLR349W 507 nt13.02□□□□□ -0.33
SLM3Q12093 UTH1YKR042W 1098 nt12.98□□□□□ -0.33
SLM3Q12093 TOM6YOR045W 186 nt12.98□□□□□ -0.33
SLM3Q12093 YGR012WYGR012W 1182 nt12.97□□□□□ -0.33
SLM3Q12093 ADH7YCR105W 1086 nt12.96□□□□□ -0.33
SLM3Q12093 YFL054CYFL054C 1941 nt12.96□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 PEX2YJL210W 816 nt12.95□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 YLR279WYLR279W 390 nt12.95□□□□□ -0.34
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