Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YLR415CYLR415C 339 nt11.18□□□□□ -0.62
YPQ1Q12010 SPC25YER018C 666 nt11.17□□□□□ -0.62
YPQ1Q12010 CCT4YDL143W 1587 nt11.16□□□□□ -0.62
YPQ1Q12010 ATF2YGR177C 1608 nt11.16□□□□□ -0.62
YPQ1Q12010 NAT4YMR069W 858 nt11.15□□□□□ -0.62
YPQ1Q12010 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.14□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 DDR2YOL052C-A 186 nt11.13□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 ERF2YLR246W 1080 nt11.11□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 GPI16YHR188C 1833 nt11.11□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 VPS60YDR486C 690 nt11.1□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 YFL067WYFL067W 528 nt11.1□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 BDF1YLR399C 2061 nt11.1□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 SEC11YIR022W 504 nt11.09□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 SWC5YBR231C 912 nt11.09□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 GLK1YCL040W 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
YPQ1Q12010 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.06□□□□□ -0.64
YPQ1Q12010 CRR1YLR213C 1269 nt11.06□□□□□ -0.64
YPQ1Q12010 ALG3YBL082C 1377 nt11.05□□□□□ -0.64
YPQ1Q12010 MSF1YPR047W 1410 nt11.04□□□□□ -0.64
YPQ1Q12010 MIR1YJR077C 936 nt11.04□□□□□ -0.64
YPQ1Q12010 FEN2YCR028C 1539 nt11.04□□□□□ -0.64
YPQ1Q12010 ANP1YEL036C 1503 nt11.02□□□□□ -0.65
YPQ1Q12010 THI74YDR438W 1113 nt11.01□□□□□ -0.65
YPQ1Q12010 VPS75YNL246W 795 nt11.01□□□□□ -0.65
YPQ1Q12010 NCP1YHR042W 2076 nt11□□□□□ -0.65
YPQ1Q12010 SNG1YGR197C 1644 nt10.98□□□□□ -0.65
YPQ1Q12010 PCH2YBR186W 1695 nt10.98□□□□□ -0.65
YPQ1Q12010 SPT8YLR055C 1809 nt10.98□□□□□ -0.65
YPQ1Q12010 TAT1YBR069C 1860 nt10.97□□□□□ -0.65
YPQ1Q12010 LYS4YDR234W 2082 nt10.96□□□□□ -0.66
YPQ1Q12010 HEM12YDR047W 1089 nt10.95□□□□□ -0.66
YPQ1Q12010 MIC10YCL057C-A 294 nt10.95□□□□□ -0.66
YPQ1Q12010 Q0182Q0182 405 nt10.94□□□□□ -0.66
YPQ1Q12010 YIR016WYIR016W 798 nt10.93□□□□□ -0.66
YPQ1Q12010 GUT2YIL155C 1950 nt10.9□□□□□ -0.66
YPQ1Q12010 DAT1YML113W 747 nt10.89□□□□□ -0.67
YPQ1Q12010 PAU7YAR020C 168 nt10.87□□□□□ -0.67
YPQ1Q12010 TIM17YJL143W 477 nt10.85□□□□□ -0.67
YPQ1Q12010 YMR244WYMR244W 1068 nt10.85□□□□□ -0.67
YPQ1Q12010 BOP3YNL042W 1191 nt10.83□□□□□ -0.68
YPQ1Q12010 YGL034CYGL034C 366 nt10.81□□□□□ -0.68
YPQ1Q12010 UBA4YHR111W 1323 nt10.81□□□□□ -0.68
YPQ1Q12010 RTF1YGL244W 1677 nt10.8□□□□□ -0.68
YPQ1Q12010 SHM2YLR058C 1410 nt10.8□□□□□ -0.68
YPQ1Q12010 SHB17YKR043C 816 nt10.79□□□□□ -0.68
YPQ1Q12010 PIB2YGL023C 1908 nt10.78□□□□□ -0.68
YPQ1Q12010 GLR1YPL091W 1452 nt10.77□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 XDJ1YLR090W 1380 nt10.77□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 YSR3YKR053C 1215 nt10.74□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 YDR010CYDR010C 333 nt10.72□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.72□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 NIT1YIL164C 600 nt10.72□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 SGT2YOR007C 1041 nt10.72□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 BNA2YJR078W 1362 nt10.72□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 XYL2YLR070C 1071 nt10.71□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 MIC12YBR262C 321 nt10.71□□□□□ -0.69
YPQ1Q12010 NDI1YML120C 1542 nt10.69□□□□□ -0.7
YPQ1Q12010 GDH3YAL062W 1374 nt10.68□□□□□ -0.7
YPQ1Q12010 RBG1YAL036C 1110 nt10.67□□□□□ -0.7
YPQ1Q12010 PTK1YKL198C 1989 nt10.66□□□□□ -0.7
YPQ1Q12010 RAX1YOR301W 1308 nt10.64□□□□□ -0.71
YPQ1Q12010 RBG2YGR173W 1107 nt10.64□□□□□ -0.71
YPQ1Q12010 PHO89YBR296C 1725 nt10.63□□□□□ -0.71
YPQ1Q12010 RET2YFR051C 1641 nt10.62□□□□□ -0.71
YPQ1Q12010 HHO1YPL127C 777 nt10.61□□□□□ -0.71
YPQ1Q12010 YGR201CYGR201C 678 nt10.6□□□□□ -0.71
YPQ1Q12010 YCR087WYCR087W 516 nt10.58□□□□□ -0.72
YPQ1Q12010 AIM45YPR004C 1035 nt10.57□□□□□ -0.72
YPQ1Q12010 AVT6YER119C 1347 nt10.55□□□□□ -0.72
YPQ1Q12010 YFL054CYFL054C 1941 nt10.5□□□□□ -0.73
YPQ1Q12010 MRP20YDR405W 792 nt10.49□□□□□ -0.73
YPQ1Q12010 COQ2YNR041C 1119 nt10.49□□□□□ -0.73
YPQ1Q12010 GOR1YNL274C 1053 nt10.48□□□□□ -0.73
YPQ1Q12010 YMR226CYMR226C 804 nt10.47□□□□□ -0.73
YPQ1Q12010 SFA1YDL168W 1161 nt10.46□□□□□ -0.73
YPQ1Q12010 DUT1YBR252W 444 nt10.46□□□□□ -0.73
YPQ1Q12010 AGP1YCL025C 1902 nt10.45□□□□□ -0.74
YPQ1Q12010 YCR102CYCR102C 1107 nt10.43□□□□□ -0.74
YPQ1Q12010 CCA1YER168C 1641 nt10.4□□□□□ -0.74
YPQ1Q12010 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.4□□□□□ -0.74
YPQ1Q12010 YLR111WYLR111W 333 nt10.36□□□□□ -0.75
YPQ1Q12010 SAM1YLR180W 1149 nt10.36□□□□□ -0.75
YPQ1Q12010 RPL4BYDR012W 1089 nt10.34□□□□□ -0.75
YPQ1Q12010 RPL4AYBR031W 1089 nt10.34□□□□□ -0.75
YPQ1Q12010 SHH4YLR164W 507 nt10.33□□□□□ -0.76
YPQ1Q12010 NBP35YGL091C 987 nt10.3□□□□□ -0.76
YPQ1Q12010 RPS14BYJL191W 417 nt10.3□□□□□ -0.76
YPQ1Q12010 SWE1YJL187C 2460 nt10.29□□□□□ -0.76
YPQ1Q12010 SDH5YOL071W 489 nt10.29□□□□□ -0.76
YPQ1Q12010 CLB6YGR109C 1143 nt10.28□□□□□ -0.76
YPQ1Q12010 TIR3YIL011W 810 nt10.27□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 TOM6YOR045W 186 nt10.26□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 RAD23YEL037C 1197 nt10.22□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 UTH1YKR042W 1098 nt10.22□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 DUS1YML080W 1272 nt10.22□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 CAB5YDR196C 726 nt10.21□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 PEX2YJL210W 816 nt10.21□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 POM34YLR018C 900 nt10.21□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.21□□□□□ -0.77
YPQ1Q12010 HIP1YGR191W 1812 nt10.21□□□□□ -0.78
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