Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 PIB2YGL023C 1908 nt12.4□□□□□ -0.42
DSE3Q08729 YFL067WYFL067W 528 nt12.38□□□□□ -0.43
DSE3Q08729 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.37□□□□□ -0.43
DSE3Q08729 YFR018CYFR018C 1092 nt12.37□□□□□ -0.43
DSE3Q08729 CRR1YLR213C 1269 nt12.37□□□□□ -0.43
DSE3Q08729 SPC25YER018C 666 nt12.36□□□□□ -0.43
DSE3Q08729 PRE6YOL038W 765 nt12.36□□□□□ -0.43
DSE3Q08729 LYS4YDR234W 2082 nt12.35□□□□□ -0.43
DSE3Q08729 CCT4YDL143W 1587 nt12.34□□□□□ -0.43
DSE3Q08729 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.33□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.32□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 YFL066CYFL066C 1179 nt12.31□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 BDH1YAL060W 1149 nt12.31□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 GPI16YHR188C 1833 nt12.3□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 PAU16YKL224C 372 nt12.3□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 VPS60YDR486C 690 nt12.29□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 MIC10YCL057C-A 294 nt12.29□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 SNG1YGR197C 1644 nt12.29□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 RRT5YFR032C 870 nt12.28□□□□□ -0.44
DSE3Q08729 HEM12YDR047W 1089 nt12.27□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 FEN2YCR028C 1539 nt12.27□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 YLR415CYLR415C 339 nt12.26□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 SWC5YBR231C 912 nt12.26□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 YSP3YOR003W 1437 nt12.26□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 ALG3YBL082C 1377 nt12.25□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 ANP1YEL036C 1503 nt12.25□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 PTK1YKL198C 1989 nt12.23□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 PEX25YPL112C 1185 nt12.23□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 YNL115CYNL115C 1935 nt12.21□□□□□ -0.45
DSE3Q08729 YIR016WYIR016W 798 nt12.16□□□□□ -0.46
DSE3Q08729 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.08□□□□□ -0.48
DSE3Q08729 YFL054CYFL054C 1941 nt12.07□□□□□ -0.48
DSE3Q08729 SPT8YLR055C 1809 nt12.07□□□□□ -0.48
DSE3Q08729 BNA2YJR078W 1362 nt12.03□□□□□ -0.48
DSE3Q08729 VPS75YNL246W 795 nt12.01□□□□□ -0.49
DSE3Q08729 RAX1YOR301W 1308 nt12□□□□□ -0.49
DSE3Q08729 TIM17YJL143W 477 nt11.97□□□□□ -0.49
DSE3Q08729 NAT4YMR069W 858 nt11.97□□□□□ -0.49
DSE3Q08729 MIC12YBR262C 321 nt11.97□□□□□ -0.49
DSE3Q08729 GLK1YCL040W 1503 nt11.96□□□□□ -0.49
DSE3Q08729 SHM2YLR058C 1410 nt11.95□□□□□ -0.5
DSE3Q08729 XDJ1YLR090W 1380 nt11.95□□□□□ -0.5
DSE3Q08729 MIR1YJR077C 936 nt11.94□□□□□ -0.5
DSE3Q08729 SBA1YKL117W 651 nt11.92□□□□□ -0.5
DSE3Q08729 HHO1YPL127C 777 nt11.91□□□□□ -0.5
DSE3Q08729 THI74YDR438W 1113 nt11.9□□□□□ -0.5
DSE3Q08729 PAU7YAR020C 168 nt11.89□□□□□ -0.51
DSE3Q08729 GDH3YAL062W 1374 nt11.89□□□□□ -0.51
DSE3Q08729 MSF1YPR047W 1410 nt11.88□□□□□ -0.51
DSE3Q08729 NIT1YIL164C 600 nt11.83□□□□□ -0.52
DSE3Q08729 SGT2YOR007C 1041 nt11.83□□□□□ -0.52
DSE3Q08729 YGR201CYGR201C 678 nt11.82□□□□□ -0.52
DSE3Q08729 CCA1YER168C 1641 nt11.8□□□□□ -0.52
DSE3Q08729 DAT1YML113W 747 nt11.8□□□□□ -0.52
DSE3Q08729 AVT6YER119C 1347 nt11.79□□□□□ -0.52
DSE3Q08729 SWE1YJL187C 2460 nt11.78□□□□□ -0.52
DSE3Q08729 SHB17YKR043C 816 nt11.77□□□□□ -0.53
DSE3Q08729 AGP1YCL025C 1902 nt11.76□□□□□ -0.53
DSE3Q08729 UBA4YHR111W 1323 nt11.76□□□□□ -0.53
DSE3Q08729 DUT1YBR252W 444 nt11.75□□□□□ -0.53
DSE3Q08729 YDR010CYDR010C 333 nt11.72□□□□□ -0.53
DSE3Q08729 GOR1YNL274C 1053 nt11.72□□□□□ -0.53
DSE3Q08729 YGL034CYGL034C 366 nt11.69□□□□□ -0.54
DSE3Q08729 YSR3YKR053C 1215 nt11.69□□□□□ -0.54
DSE3Q08729 XYL2YLR070C 1071 nt11.65□□□□□ -0.54
DSE3Q08729 PHO89YBR296C 1725 nt11.62□□□□□ -0.55
DSE3Q08729 RET2YFR051C 1641 nt11.6□□□□□ -0.55
DSE3Q08729 DUS1YML080W 1272 nt11.6□□□□□ -0.55
DSE3Q08729 YCR102CYCR102C 1107 nt11.59□□□□□ -0.55
DSE3Q08729 RBG1YAL036C 1110 nt11.56□□□□□ -0.56
DSE3Q08729 NDI1YML120C 1542 nt11.53□□□□□ -0.56
DSE3Q08729 YMR244WYMR244W 1068 nt11.52□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 NVJ2YPR091C 2313 nt11.51□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 YCR087WYCR087W 516 nt11.5□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 SFA1YDL168W 1161 nt11.5□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 STR3YGL184C 1398 nt11.5□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 GLR1YPL091W 1452 nt11.5□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 AQY2YLL052C 450 nt11.49□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 NBP35YGL091C 987 nt11.48□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 COQ2YNR041C 1119 nt11.48□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 AIM45YPR004C 1035 nt11.48□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 MRP20YDR405W 792 nt11.47□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.47□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.46□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.46□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 SHH4YLR164W 507 nt11.46□□□□□ -0.57
DSE3Q08729 PAC11YDR488C 1602 nt11.46□□□□□ -0.58
DSE3Q08729 YCL074WYCL074W 927 nt11.44□□□□□ -0.58
DSE3Q08729 FUR4YBR021W 1902 nt11.39□□□□□ -0.59
DSE3Q08729 TIR3YIL011W 810 nt11.39□□□□□ -0.59
DSE3Q08729 TOM6YOR045W 186 nt11.35□□□□□ -0.59
DSE3Q08729 POM34YLR018C 900 nt11.32□□□□□ -0.6
DSE3Q08729 PRO1YDR300C 1287 nt11.3□□□□□ -0.6
DSE3Q08729 RPL4BYDR012W 1089 nt11.29□□□□□ -0.6
DSE3Q08729 RBG2YGR173W 1107 nt11.29□□□□□ -0.6
DSE3Q08729 PEX2YJL210W 816 nt11.29□□□□□ -0.6
DSE3Q08729 RPL4AYBR031W 1089 nt11.29□□□□□ -0.6
DSE3Q08729 CLB6YGR109C 1143 nt11.26□□□□□ -0.61
DSE3Q08729 LSC2YGR244C 1284 nt11.25□□□□□ -0.61
DSE3Q08729 RPS14BYJL191W 417 nt11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.8 ms